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SFB 1638: Umbau von zellulären Membranen – wie veränderte Form Funktion schafft
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung seit 2024
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 511488495
Membranen sind von grundlegender Bedeutung für die Entstehung komplexer zellulärer Architekturen, wie die Kompartimentierung eukaryontischer Zellen zeigt. Biologische Membranen sind dynamische Strukturen mit einer anpassungsfähigen Zusammensetzung von Lipiden und Proteinen. Der Membranumbau, der Prozess der Veränderung der Zusammensetzung oder Konfiguration biologischer Membranen, erzeugt die Architektur einer Zelle und bestimmt deren Physiologie. Jede Zellmembran ist einem Umbau unterworfen, und die Vielfalt der verschiedenen Membrankonfigurationen ist eng mit biologischen Funktionen verknüpft. Es überrascht nicht, dass viele verschiedene Prozesse beschrieben wurden, bei denen Zellen ihre Membranen umgestalten. Die molekularen Mechanismen der meisten Membranumbauprozesse sind jedoch nur teilweise verstanden oder noch völlig unbekannt. Die allgemeinen Prinzipien des Membranumbaus sind noch nicht geklärt, und es fehlt ein umfassendes Verständnis dafür, wie Zellen diese allgemeinen Prinzipien nutzen, um spezifische Funktionen zu erzeugen. Mit diesem SFB wollen wir diese Wissenslücke von einem konzeptionellen Standpunkt aus schließen. Wir gehen davon aus, dass die große biologische Vielfalt auf vier grundlegende Arten des Membranumbaus zurückzuführen ist: transversale und laterale Segregation sowie morphologische und topologische Transformation. Ein Schwerpunkt dieses SFB ist der Nachweis der Hypothese, dass Zellen die vier grundlegenden Arten des Membranumbaus auf modulare Weise koppeln und dass diese Kopplung zu gerichteten Sequenzen von Umbauereignissen führt, die spezifische biologische Funktionen erzeugen. Unsere Ziele sind die Identifizierung der Umbauwege und der beteiligten Komponenten, die Aufklärung der Mechanismen der zellulären Membranumbauvorgänge, die Feststellung, wie einzelne Membranumbauvorgänge gekoppelt sind, und das Verständnis, wie eine Reihe gekoppelter Membranumbauvorgänge zusammenwirken und zu funktionellen Umschaltungen führen. Um diese Ziele zu erreichen, haben wir Projekte zusammengestellt, die ein breites Spektrum biologischer Prozesse untersuchen, die entscheidend von Membranumbauvorgängen abhängen und an verschiedenen Zellmembranen ablaufen. Unsere Projekte reichen von der Identifizierung von Signalwegen und der molekularen Akteure, die an bestimmten membranbasierten Prozessen beteiligt sind, bis hin zum Verständnis von Membranumbauvorgängen bei atomarer Auflösung. Unser Programm wird von einem gemeinsamen Ziel geleitet: die universelle Logik der Kopplung von Membranumbauereignissen zu definieren. Langfristig werden wir zeigen, dass unser Verständnis robust genug ist, um viele der untersuchten Prozesse mit gereinigten Komponenten zu rekonstruieren. Der Nachbau dieser Wege und ihre Manipulation mit neu entwickelten Wirkstoffen wird zu neuen Wegen zur Beeinflussung biologischer Prozesse unter physiologischen und pathologischen Bedingungen führen.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Laufende Projekte
- P01 - Systematische Analyse der ER-formenden Reticulon- und REEP-Proteine (Teilprojektleiterin Schlaitz, Anne-Lore )
- P02 - Mechanismen der Morphogenese des Endoplasmatischen Retikulums (Teilprojektleiter Schuck, Sebastian )
- P03 - Membranumbau durch SARS-CoV-2-Proteine (Teilprojektleiter Chlanda, Petr ; Schwarz, Ulrich )
- P04 - Struktur-Funktions-Analyse des Membranumbaus bei der Insertion von tail-anchor Proteinen in die ER Membran (Teilprojektleiterin Sinning, Irmgard )
- P05 - Membranfluidität und Lipidtröpfchenbildung im ER proximaler Tubuluszellen der Niere (Teilprojektleiter Simons, Matias )
- P06 - Umbau der Kernmembran während der Insertion des Porenkomplexes (Teilprojektleiter Ellenberg, Jan )
- P07 - Fusion der inneren und äußeren Kernmembran während der Assemblierung von Kernporen (Teilprojektleiter Schiebel, Elmar )
- P08 - Membranremodelierung während des mitochondrialen Lipidtransfers (Teilprojektleiter Meinecke, Michael )
- P09 - Membranveränderungen während der mitochondrialen Stressantwort (Teilprojektleiterin Vögtle, Friederike-Nora )
- P10 - Synaptische Exozytose: Dynamische molekulare Anordnungen und Zwischenprodukte auf dem Weg zur Verschmelzung von Lipiddoppelschichten (Teilprojektleiter Söllner, Thomas )
- P11 - Molekularer Mechanismus der Bildung von Disulfidbrücken zur Oligomerisierung und Membrantranslokation von FGF2 (Teilprojektleiter Dick, Tobias ; Nickel, Walter )
- P12 - Mechanische Steuerung der Membrankrümmung bei der Endozytose (Teilprojektleiterinnen Cavalcanti-Adam, Elisabetta Ada ; Diz-Muñoz, Alba )
- P13 - Mechanischer und chemischer Crosstalk zwischen Membranen und verankerten Mechanokinasen (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Gräter, Frauke ; Nickel, Walter )
- P14 - ESCRT-III-vermittelter Membranumbau in Archaea und Eukarya (Teilprojektleiter Moser von Filseck, Joachim )
- P15 - Modellierung von Lipidmembranen mit DNA/RNA-Nanotechnologie (Teilprojektleiterin Göpfrich, Kerstin )
- Z01 - Molekulardynamik-Simulationen von Membransystemen (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Gräter, Frauke ; Lolicato, Fabio )
- Z02 - Lipid-Imaging und Lipidomics (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Brügger, Britta ; Hopf, Carsten )
- Z03 - Kryo-EM und kryo-korrelative Ansätze zur Untersuchung von Membranumstrukturierungen (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Chlanda, Petr ; Paulino, Cristina )
- Z04 - Zentrales Verwaltungsprojekt (Teilprojektleiter Meinecke, Michael )
- ZINF - Informationsinfrastruktur für SFB1638 (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Kopp, Jürgen ; Sinning, Irmgard )
Antragstellende Institution
Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
Beteiligte Hochschule
Hochschule Mannheim
Beteiligte Institution
Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ); European Molecular Biology Laboratory (EMBL); Max-Planck-Institut für medizinische Forschung
Sprecher
Professor Dr. Michael Meinecke