Infrastruktur zur Information, Datenbasis und Entwicklung von Werkzeugen für die Bioinformatik (INF)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 34509606

Das INF-Projekt hat zwei Ziele: 1. Die Weiterentwicklung von bioinformatischen Anwendungen für das Projekt mit Schwerpunkt auf der Datenanalyse und mathematischen Modellierung von Genregulationsprozessen in D. shibae. Dafür werden die Arbeiten mit der Plattform-unabhängigen PRODORIC Datenbasis beendet und mit den Datenbänken BRENDA, BacDive, KEGG und Pfam verlinkt für die Nutzung mittels des Werkzeuges Virtual Footprint. 2. Sequenzierung, Assemblierung und sorgfältige Annotation des Genomes von P. minimum. Eine übergeordnete Strategie zur Datenverwaltung und -pflege wird zudem entwickelt werden und implementiert in enger Zusammenarbeit mit der Universitätsbibliothek Braunschweig.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 51: Ökologie, Physiologie und Molekularbiologie der Roseobacter-Gruppe: Aufbruch zu einem systembiologischen Verständnis einer global wichtigen Gruppe mariner Bakterien
• Antragstellende Institution: Carl von Ossietzky Universität Oldenburg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Dieter Jahn; Dr. Richard Münch, bis 12/2017