Q-TOF Massenspektrometer
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Das Q-TOF Massenspektrometer 6530 Accurate Mass Q-TOF Mass Spectrometer wurde im Dezember 2008 in unserer Abteilung im IMBIO Institut, Universität Bonn aufgestellt. Es wird hauptsächlich zur Messung von Lipiden aus Pflanzen und Bakterien eingesetzt. In Zusammenarbeit mit anderen Gruppen werden auch die Lipide aus Mäusen gemessen. Zunächst wurden Methoden zur Lipidextraktion und Aufreinigung für die wichtigsten Lipide etabliert. Mittlerweile haben wir Verfahren zur Quantifizierung von Phospholipiden, pflanzlichen Galactolipiden, nichtpolaren Lipiden (Triacylglycerol, Diacylglycerol, Wachsester) und Sphingolipiden (Glucosylceramid, Ceramid, LCB, GIPC, Ganglioside, Sulfatide) erarbeitet. Wir haben zum ersten Mal eine Methode entwickelt, mit der alle vier Sterol-Lipid-Klassen (freie Sterole, Sterolester, Sterolglucoside, Acylierte Sterolglucoside) in Pflanzen gemessen werden können. Die Methode zur Wachsester-und Triacylglycerol-Messung wurde in Arabidopsis Mutanten und Hefe eingesetzt. Aufgrund seiner hohen Massengenauigkeit ist das Massenspektrometer auch sehr gut einsetzbar für die Strukturaufklärung bzw. Strukturbestätigung verschiedener Lipide aus Pflanzen oder Bakterien. In Zusammenarbeit mit anderen Gruppen werden Sphingolipide in Ceramid-Synthase und Connexin Mutanten der Maus gemessen. Das Q-TOF Massenspektrometer ist mittlerweile unverzichtbarer Bestandteil in vielen Projekten und Kollaborationen und wird auch für zukünftige Projektanträge eingesetzt.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- (2010) Intersection of the tocopherol and plastoquinol metabolic pathways at the plastoglobule. Biochem J. 425, 389-399
Zbierzak A.M., Kanwischer M., Wille C., Vidi P.A., Giavalisco P., Lohmann A., Briesen I., Porfirova S., Bréhélin C., Kessler F. and Dörmann P.
- (2011) A processive glycosyltransferase involved in glycolipid synthesis during phosphate deprivation in Mesorhizobium loti. J. Bacteriol. 193, 1377-1384
Devers E.A., Wewer V., Dombrink I., Dörmann P. and Hölzl G.
- (2011) Quantification of sterol lipids in plants by quadrupole time of flight mass spectrometry. J. Lipid Res. 52, 1039-1054
Wewer V., Dombrink I., vom Dorp K. and Dörmann P.
- (2012). Fatty acid phytyl ester synthesis in chloroplasts of Arabidopsis thaliana. Plant Cell 24, 2001-2014
Lippold, F., vom Dorp, K., Abraham, M., Hölzl, G., Wewer, V., Lindberg Yilmaz, J., Lager, I., Montandon, C., Besagni, C., Kessler, F., Stymne, S., and Dörmann, P.
