Post-translationale Modifikationen von C/EBPß und funktionelle Implikationen

• Antragsteller: Professor Dr. Achim Leutz
• Fachliche Zuordnung: Entwicklungsbiologie
• Förderung: Förderung von 2008 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 70796845

Von dem Weg bereitenden (Pionier-) Transkriptionsfaktor C/EBPbeta wurde mit zwei sich ergänzenden Suchmethoden (APS und PRISMA) ein umfassendes und von post-translationalen Protein Modifikationen (PTM) abhängiges Protein-Interaktom erstellt und dabei 650 bzw. 1500 Proteine identifiziert. In der experimentellen lymphoid-myeloiden Transdifferenzierung zeigte sich, dass die myeloide Sub-Linien Differenzierung C/EBPbeta PTM abhängig ist. Die Ergebnisse legen damit als ursächlichen Mechanismus einen epigenetischen C/EBPbeta PTM Index-Code nahe. Gemischte Expression zelltyp-spezifischer Marker ist ein auffallendes Merkmal bestimmter Lymphome, insbesondere der Hodgkin-, Grosszellig-Anaplastischen und Mantelzell-Lymphome, sowie des Multiplen Myeloms. Wir vermuten einen Zusammenhang bei der Tumorentstehung zwischen dem Umschalten der Zellidentität durch Transdifferenzierungsvorgänge und einem selektivem Wachstumsvorteil. Um die zentralen Funktionen von C/EBPbeta bei der Transformation und lympho-myeloiden Reprogrammierung festzustellen werden wir mit massenspektrometrischen Verfahren den PTM Index sowie das Interaktom von C/EBPbeta in Lymphom-Zellinien und primären Zellen bestimmen und die gewonnen Erkenntnisse mit CRISPR/Cas9 basierter funktioneller genomischer Komplementation unter Anwendung von C/EBPbeta Mutanten in einer Grosszellig-Anaplastischen Lymphomzellinie untersuchen. Zudem wurde die SUMOylierung von C/EBPbeta als eine dynamische PTM erkannt und als Engpass für weitere Modifikationen identifiziert. C/EBPalpha,beta SUMOylierungs¬defiziente rekombinante Mausstämme wurden bereits hergestellt und werden nun untersucht, um herauszufinden wie Signaltransduktionsvorgänge mit C/EBPbeta Modifikation und nachfolgenden epigenetischen Funktionen verbunden sind.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen