Empfindliches Hybrid-Massenspektrometer für funktionelle Proteomanalysen mengenlimitierter Proben

• Fachliche Zuordnung: Grundlagen der Biologie und Medizin
• Förderung: Förderung in 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 549877627

Wir beantragen ein schnelles und empfindliches Nanoflow-Flüssigchromatographie-gekoppeltes Tandem-Massenspektrometer (nanoLC-MS/MS) für funktionelle Proteomanalysen mengenlimitierter Proben in der Signalforschung. Die Entschlüsselung molekularer Mechanismen der biologischen Signalintegration ist ein Ziel des Exzellenzclusters CIBSS-Centre for Integrative Biological Signalling Studies, Forschungsschwerpunkt der Fakultät für Biologie und Teil des Forschungsschwerpunkts "Signals of Life" der Universität Freiburg. Die Massenspektrometrie-basierte Proteomanalytik ermöglicht eine Bestimmung von posttranslationalen Proteinmodifikationen, Proteininteraktionen und Proteinmengen und ihren Änderungen und ist daher eine Schlüsseltechnologie für die molekulare Signalforschung. Viele Signalprozesse laufen zeitlich und räumlich begrenzt in wenigen Zellen ab. Daher ist für viele Fragestellungen eine Analyse von Proben mit begrenzten Mengen an Ausgangsmaterial erforderlich, wie z.B. Proteinextrakte aus FACS-sortierten Zellen oder (mikro-)dissektierten Geweben. Derzeit steht dem Exzellenzcluster CIBSS und der Fakultät für Biologie kein ausreichend empfindliches Massenspektrometer für derartige Analysen zur Verfügung. Das beantragte Instrument wird dringend benötigt, um 1) hochempfindliche Analysen posttranslationaler Proteinmodifikationen in mengenbegrenzten Proben zu ermöglichen und 2) ausreichende Messkapazität für CIBSS, die Fakultät für Biologie und die Gruppe des Hauptantragstellers, der kürzlich an die Universität Freiburg berufen wurde, bereitzustellen. Das Massenspektrometer wird von erfahrenen, entfristeten Mitarbeitenden in der Gruppe des Hauptantragstellers betrieben werden und als Forschungsinfrastruktur über die Proteomics Unit Biology, eine neu eingerichtete Shared Facility der Fakultät für Biologie, zugänglich sein.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Empfindliches Hybrid-Massenspektrometer für funktionelle Proteomanalysen mengenlimitierter Proben
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
• Leiter: Professor Dr. Pitter Huesgen