Modellierung, Verständnis und Vorhersage von >2 Millionen Arabidopsis-Proteoformen im postgenomischen Zeitalter (D01)

Fachliche Zuordnung Genetik und Genomik der Pflanzen
Biochemie und Biophysik der Pflanzen
Bioinformatik und Theoretische Biologie
Strukturbiologie
Förderung Förderung seit 2024
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 514901783
 

Projektbeschreibung

D01 modelliert Arabidopsis-Proteoformen auf proteomweiter Ebene. Angesichts begrenzter Proteinstrukturen verknüpft das Projekt genomische Daten aus SNPstar mit Struktur- und Funktionsvorhersagen. Diese Initiative schafft eine entscheidende strukturelle Bioinformatik-Ressource, einen umfassenden Atlas für nsSNP-Effekte in Arabidopsis. Diese Ressource erleichtert die Erforschung genetischer Variationen und ihrer phänotypischen Auswirkungen, wovon mehrere CRC-Projekte profitieren. Sie bildet zudem die Grundlage für die Verbesserung von Pflanzenproteinen in nachfolgenden Förderperioden.
DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche
Teilprojekt zu SFB 1664:  Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot
Antragstellende Institution Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Teilprojektleiter Professor Dr. Panagiotis L. Kastritis; Dr. Georg Künze