Mutationssensitive Vorhersage von Transkriptionsfaktor-DNA-Wechselwirkungen in Pflanzen (A03)

In diesem Bioinformatik-Projekt wird die Interaktion zwischen Transkriptionsfaktor (TF)-Proteoformen und ihren cis-regulierenden Zielpromotoren analysiert. Durch die Integration der Identifizierung von Mustern auf DNA-Ebene und der 3-D-Strukturmodellierung werden die doppelten Auswirkungen der genomischen Variation auf die TF-Funktion untersucht, mit Fokus auf strukturellen Unterschieden in DNA-bindenden Domänen und nicht-kodierenden genetischen Variationen in Promotoren. Die simultane Analyse dieser beiden Ebenen ermöglicht das Verstehen der Co-Evolution von TFs und ihren Bindungsstellen.

DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche

Teilprojekt zu SFB 1664:  Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot

Antragstellende Institution Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg

Teilprojektleiter Professor Dr. Ivo Große; Professor Dr. Jens Meiler