Hochauflösendes Elektrospray-Massenspektrometrie System gekoppelt an Flüssigkeitschromatografie

• Fachliche Zuordnung: Grundlagen der Biologie und Medizin
• Förderung: Förderung in 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 540643320

Hochauflösende Massenspektrometrie gekoppelt mit Flüssigkeitschromatographie (LC-MS) ist eine Schlüsseltechnologie für Proteomanalysen in den molekularen Biowissenschaften inklusive Biomedizin. Um den großen Bedarf an hochwertigen MS-basierten proteomischen Analysen an der Julius-Maximilians-Universität (JMU) zu decken, werden ein hochmodernes Flüssigkeitschromatographe (LC)-MS-Gerät zusammen mit einem Liquid-Handling-System für automatisierte Probenprozessierung beantragt. Das Tandem-MS (MS/MS) Instrument ist ausgestattet mit Higher-Energy Collisional Dissociation und einem hochauflösenden Orbitrap-Massenanalysator, was zusammen eine exakte Identifizierung von Peptiden und posttranslationalen Modifikationen bei hoher Sensitivität und schneller Scangeschwindigkeit ermöglicht. Das LC-MS-System ist insbesondere geeignet für quantitative Proteomstudien unter Anwendung von markierungsfreien Ansätzen, Methoden der stabilen Isotopenmarkierung oder der isobaren Tandem Mass Tagging Technologie. Je nach wissenschaftlicher Fragestellung und Zielvorgaben eines Projektes bietet das MS-Gerät die Möglichkeit zu explorativen datenabhängigen Analysen, Parallel Reaction Monitoring für gerichtete Peptidanalysen oder zu datenunabhängigen MS/MS-Analysen für eine exakte Peptid-/Proteinquantifizierung über zahlreiche Proben. Es ist ausgestattet mit einem Ionenmobilitätsinterface, das die Qualität der Spektren insgesamt verbessert und die Ausfallzeit aufgrund von Wartungsarbeiten vermindert, indem Hintergrundionen vorgefiltert und vor dem Eintreten in das MS-Gerät entfernt werden. Das beantragte Liquid-Handling-System ist essenziell für eine höchst effiziente und in hohem Maße reproduzierbare Prozessierung einer großen Anzahl an unterschiedlichen Proben der Antragsteller sowie zahlreicher Kollaborationspartner von innerhalb und außerhalb der JMU. Die gesamte instrumentelle Set-up ist von zentraler Bedeutung für die Etablierung einer innovativen bioanalytischen MS-Technologie-Plattform am Biozentrum der JMU. Diese wird Technologie für die hochmoderne Proteomik bereitstellen, welche die molekulare Forschung innerhalb der Biowissenschaften und der Medizin an der JMU weiter vorantreiben werden.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Hochauflösendes Elektrospray-Massenspektrometrie System gekoppelt an Flüssigkeitschromatografie
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Julius-Maximilians-Universität Würzburg
• Leiterin: Professorin Dr. Bettina Warscheid