Structure of protein-RNA interaction in ribosomes

• Applicant: Professorin Dr. Brigitte Wittmann-Liebold
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 1999 to 2002
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5201110

Die Quervernetzungsstudien an Ribosomen führten bisher zur Aufklärung von etwa 30 Kontaktstellen zwischen RNA und Proteinen in den E. coli und B. stearothermophilus ribosomalen Untereinheiten auf der molekularen Ebene. Ein neuer Ansatz zur Quervernetzung, Isolierung und Analyse von Oligonukleotid-Peptid-Heteromeren wurde entwickelt, um viele der Kontaktbereiche zwischen den RNAs und den Bindungsproteinen aufzuklären. Die bisher gewonnenen Ergebnisse bilden die Grundlage für die Verfeinerung der bestehenden strukturellen Modelle der Untereinheiten und erlauben die bekannten 3D-Strukturen der r-Proteine in die Modelle der RNAs einzupassen. Die Studien haben Modellcharakter auch für die Aufklärung von RNA-Protein-Wechselwirkungen in anderen RNP-Partikeln der Zelle. Im Fortsetzungsantrag sollen die spezifischen Raumstrukturen der Kontaktstellen untersucht und Kokristallisationen zwischen RNA und Bindungsproteinen durchgeführt werden. Die Kristallisation rekombinant gewonnener r-Proteine des Peptidyltransferase-Zentrums soll fortgesetzt werden.

• DFG Programme: Research Grants
• International Connection: Greece, Russia
• Participating Persons: Professorin Dr. Theodora Chow-Papadopoulou; Professor Dr. T. Egorov; Professor Dr. A. Kopylov; Dr. Albrecht Otto