Mikrobiom-basierte Therapie bei nekrotisierender Enterokolitis (NP19)

• Fachliche Zuordnung: Medizinische Mikrobiologie und Mykologie, Hygiene, Molekulare Infektionsbiologie ; Gastroenterologie ; Virologie
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 395357507

Die nekrotisierende Enterokolitis (NEC) ist eine schwerwiegende Erkrankung, von der 5-15 % der Frühgeborenen betroffen sind und die mit einem übermäßigen Wachstum von multiresistenten pathogenen Mikroorganismen einhergeht. Es besteht ein eindeutiger Bedarf an neuen Behandlungsansätzen, die die Gefahr einer Antibiotikaresistenz umgehen. (Bakterio-)Phagen stellen eine attraktive therapeutische Anwendung dar. In diesem neuen Projekt werden die wichtigsten Bakterienarten, die mit NEC in Verbindung gebracht werden, durch eine Kombination von Metagenomik, Kultivierungs- und Ganzgenomsequenzierungsstudien erforscht und Beziehungen auf Stammebene definiert. Mit Hilfe modernster Phagenisolierungs- und -charakterisierungsverfahren werden wir Phagenisolate und optimale Phagenkombinationen gegen die wichtigsten NEC-verursachenden Erreger identifizieren und mit Hilfe von Modell-Darm-Systemen beschreiben, wie Phagen Frühgeborenen-Mikrobiota, einschließlich probiotischer Gattungen, beeinflussen. Schließlich werden wir nach einem Pre-Screening einer breiten Palette von Phagen-Pathogen-Kombinationen im Wachsmotten-in-vivo-Modell die Wirksamkeit der wichtigsten Phagen-Cocktails gegen NEC-Erreger anhand klinisch relevanter Schweinemodelle bestimmen und so optimale therapeutische Produkte definieren, die in der nächsten Finanzierungsphase in der Klinik getestet werden sollen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1371: Microbiome Signatures -- Funktionelle Relevanz des Mikrobioms im Verdauungstrakt
• Antragstellende Institution: Technische Universität München (TUM)
• Teilprojektleiterinnen: Professorin Dr. Li Deng; Professorin Dr. Friederike Ebner, seit 9/2023; Professorin Lindsay Hall, Ph.D., bis 8/2023