Molekulare Mechanismen der 5mC Oxidation und ihre Auswirkung auf Chromatin Struktur und Generegulation (A08*)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2022
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 325871075

Die konsekutive Oxidation von 5mC durch Tet Enzyme führt zu der Entstehung von 5hmC, 5fC und, in einigen Fällen, 5caC. Diese oxidativen Cytosinformen (oxCs) spielen eine essenzielle Rolle bei der Demethylierung von DNA und besitzen womöglich einzigartige regulatorische Funktionen. Mittels «Third-Generation-Sequencing» analysieren wir simultan 5mC, oxCs und die Chromatinzugänglichkeit auf einzelnen DNA-Molekülen. Die Analyse dieser komplexen Datensätze ermöglicht es uns, die genaue Position und das gemeinsame Auftreten modifizierter Cytosine innerhalb des Genoms zu bestimmen und, darüber hinaus, den Einfluss von oxCs auf die Chromatinstruktur und Genregulation zu erfassen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1309: Chemische Biologie epigenetischer Modifikationen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Dr. Peter Pascal Giehr