Der mechano-genomische Code: Pionierfaktoren als Entscheidungsträger (P04)

• Fachliche Zuordnung: Medizininformatik und medizinische Bioinformatik
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 427826188

In diesem Projekt soll der Code der mechano-spezifischen Pionier-Transkriptionsfaktoren (TF) in Endothelzellen entschlüssel werden. Sie werden mehrere auf Next-Generation-Sequencing basierende Assays integrieren, um die genomische Regulierung von durch Flüssigkeitsscherstress (FSS) induzierten Veränderungen der Zellform zu verstehen und genomische Loci zu identifizieren, die von SMAD- und Pionier-TF-Komplexen gebunden werden. Anschließend werden sie die Mechanoresponsivität dieser zusammengesetzten Motive in Luziferase-Reportergen-Assays bewerten. Durch den Vergleich verschiedener Zelltypen, die demselben mechanischen Stimulus ausgesetzt sind, werden diese Mechano-Reporter letztlich dazu beitragen, zu bewerten, ob es einen gemeinsamen mechanisch-genomischen Pionier-TF-Code gibt.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1444: Gezielte zelluläre Selbstorganisation zur Förderung der Knochenregeneration
• Antragstellende Institution: Gemeinsam FU Berlin und HU Berlin durch:; Charité - Universitätsmedizin Berlin
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professorin Dr. Petra Knaus; Professor Dr. Stefan Mundlos