Compute Cluster

• Förderung: Förderung in 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 436586093

Mit diesem Antrag wird die Anschaffung eines Computerfarm-Clusters für speicher- und eingabe-/ausgabeintensive Anwendungen beabsichtigt. Er soll Berechnungen in den Bereichen Quantenmechanik, Multiskalen-Quantenmechanik / Molekularmechanik sowie Quantenmechanik / Molekularmechanik / Coarse-Grain-Verfahren ermöglichen, die nicht in einer massiv parallelen Weise durchgeführt werden können. Die Maschine wird eingesetzt für: i) die Untersuchung der Regulationsmechanismen der enzymatischen Aktivität durch Faktoren wie Solvatation (auch unter extremen Bedingungen), allosterische Effekte und Nano-Confinement, einschließlich künstlicher biomimetischerinspirierter Systeme, ii) die rechnerische Optimierung und das Design von supramolekularen und peptidbasierten Liganden, die die Proteinfunktion regulieren und iii) die Untersuchung der Regulation chemischer Reaktivität, von Interkombinations- und Tunnelprozessen in transienten Spezies und anderen komplexen organischen Molekülen durch Lösungsmitteleffekte.Das Gerät wird den Bedarf an Ressourcen für rechenintensive Forschungsprojekte und neue Kooperationen abdecken, die in der neu eingerichteten Gruppe Computational Biochemistry entwickelt wurden und werden. Die Arbeit wird hauptsächlich im Rahmen von Verbundforschungsprojekten der Fakultät für Biologie der Universität Duisburg-Essen und der UA Ruhr durchgeführt. Die Bedarf an Rechenressourcen ist auch eine Folge des Ausbaus der Forschungslinien der Gruppe Computational Biochemistry innerhalb des Exzellenzclusters EXC 2033 RESOLV und der Sonderforschungsbereiche 1093 und 1279.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Compute Cluster
• Gerätegruppe: 7000 Datenverarbeitungsanlagen, zentrale Rechenanlagen
• Antragstellende Institution: Universität Duisburg-Essen
• Leiterin: Professorin Dr. Elsa Sanchez Garcia