Ursachen und Folgen der intrinsischen Genominstabilität in verschiedenen menschlichen Zelltypen (13)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 393547839

Dieses Projekt soll aufklären, wie die Einflüsse von Transkription, DNA-Topologie und Replikation bestimmen, welche Regionen des Genoms bevorzugt DNA-Brüche erleiden. Wir werden untersuchen, ob die intrinsische DNA-Fragilität zwischen Zelltypen variiert und wie dies mit genomischen Veränderungen in Krebs zusammenhängt. Dafür haben wir eine vollwertige Bioinformatik-Säule aufgebaut, um aufwendige genomische Ansätze mit multimodaler Daten-Integration, quantitativen Vergleichen und maschinellem Lernen zu kombinieren. Unser Projekt stellt experimentelle und bioinformatische Werkzeuge zur Untersuchung der genomischen Instabilität bereit und leistet einen wichtigen Beitrag zum verstärkten Schwerpunkt des Konsortiums auf Systemansätzen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1361: Regulation von DNA-Reparatur und Genomstabilität
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Dr. Vassilis Roukos; Professorin Dr. Katharina Zarnack, seit 1/2023