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SPP 2191: Molekulare Mechanismen funktioneller Phasenseparation
Fachliche Zuordnung
Biologie
Chemie
Mathematik
Medizin
Physik
Chemie
Mathematik
Medizin
Physik
Förderung
Förderung seit 2019
Webseite
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Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 402723784
Die Entwicklung der komplexen Lebensform der Eukaryoten erforderte die Bildung von Kompartments und die Separation von zellulären Prozessen in diese Kompartments. Diese Kompartments sind häufig Membran-umschlossene Strukturen wie der Zellkern, Mitochondria etc. Neben den Membran-umschlossenen Kompartments existieren die membranlosen Organellen, zu denen der Nukleolus, Stress Granules etc. zählen. Obwohl membranlose Organellen schon lange bekannt sind, wurde erst im letzten Jahrzehnt ersichtlich, dass ihre Bildung auf dem physikalischen Prinzip der Phasenseparation beruht, was ihnen gleichzeitig einzigartige Eigenschaften verleiht: Membranlose Organellen können reversibel sein, hoch dynamisch und kontinuierlich Moleküle mit ihrer Umgebung austauschen ohne sich dazu eines Transportsystems bedienen zu müssen. Diese Eigenschaften erfordern es, den Aufbau von Zellen und die existierenden Konzepte zur Zellkompartimentalisierung, sowie die Regulation von (inner)zellulärem Transport und Funktionen neu zu überdenken – „Zellbiologie 2.0“. Zur Erforschung dieser neuen Konzepte und zum Verständnis der Mechanismen, die der Bildung von membranlosen Organellen durch Phasenseparation zugrunde liegen, müssen Zellbiologie und Biophysik sowohl mit Biochemie, also auch mit theoretischen Modellen kombiniert werden und neue Techniken entwickelt sowie neue Zugänge zur Thematik erschlossen werden. Die Kombination der Disziplinen erlaubt es, testbare Vorhersagen zur Rolle der Phasenseparation in diversen biologischen Prozessen zu treffen, welche in funktionellen biochemischen, zellbiologischen und entwicklungsbiologischen Experimenten sowie in Krankheitsmodellen validiert werden. Die Forschung des letzten Jahrzehnts hat in diesem Bereich nur an der Oberfläche der Komplexität gekratzt, die der Bildung und Funktionalität von biologischen Kondensaten zugrunde liegt. Neben dem anfänglichen Fokus auf die Rolle der Phasenseparation in (zell)biologischen Prozessen wurde die Forschung jüngst auf solidere Kondensate ausgeweitet, die eine weitere Dimension der funktionellen Regulation bieten. Dieses Schwerpunktprogramm bietet Wissenschaftler*Innen unterschiedlicher Disziplinen, Forschungsumgebungen und wissenschaftlichen Werdegangs eine Plattform für gemeinsame Diskussion und Forschung. Das Programm erlaubt es Wissenschaftler*Innen synergistisch zusammen zu wirken zur Entschlüsselung neuer Funktionen und zur Entschlüsselung von Krankheitsbildern, die auf Kondensationsprozessen beruhen und die molekularen Mechanismen zu verstehen. In Rahmen dessen wird das Schwerpunktprogramm eine neue Generation von Wissenschaftler*Innen heranziehen, die die Grenzen der Disziplinen und Forschungsfelder überschreiten und aufkommende zentrale Fragen und Probleme der Lebenswissenschaften aus dem Blickwinkel der biologischen Kondensate betrachten.
DFG-Verfahren
Schwerpunktprogramme
Internationaler Bezug
Großbritannien
Projekte
- Aktive Mikroemulsifikation als Prinzip der Chromatinorganisation und als Aspekt der Zelltypspezifizierung (Antragsteller Hilbert, Ph.D., Lennart ; Zaburdaev, Ph.D., Vasily )
- Analyse der Prinzipien der CTCF-Kondensatbildung bei der Zellalterung (Antragsteller Papantonis, Argyris )
- Aufdeckung des Beitrags von Phasentrennung zur Bildung von Heterochromatin-Domänen (Antragsteller Imhof, Axel ; Rippe, Karsten )
- Die Entstehung von phasengetrennten Transkriptionszentren und ihre Funktion in der Transkriptionsregulation (Antragstellerinnen / Antragsteller Brugués, Ph.D., Jan ; Vastenhouw, Nadine )
- Dynamik und Pufferfunktionen von intranukleären Actin-Cofilin Zusammensetzungen in zellulärer Stressantwort (Antragstellerin Mahamid, Ph.D., Julia )
- Entwicklung eines kombinierten Fluoreszenz, Optische Beugungstomographie und Brillouin (FOB) Mikroskops für die quantitative Untersuchung von Phasenübergängen in Zellen (Antragsteller Alberti, Simon ; Guck, Jochen )
- Konformationsselektion bei der Flüssig-Flüssig-Phasenseparation: Proteinfaltungs- und Aggregationsmechanismen im Zytoplasma und in Stresskörperchen (Antragsteller Ebbinghaus, Simon )
- Koordinationsfonds (Antragsteller Lemke, Edward A. )
- Mechanismen der biomolekularen Kondensation während bakterieller Transkription ribosomaler RNA (Antragstellerinnen / Antragsteller Duss, Ph.D., Olivier ; Hennig, Janosch ; Mahamid, Ph.D., Julia )
- Membranprotein Phasentrennung in der Kernmembranschliessung und -fusion (Antragsteller von Appen, Alexander )
- Mikrofluidische Analyse der Mehrfachphasentrennung in der Ubiquitin-vermittelten Proteostasis. (Antragsteller Heymann, Michael )
- Molekulare Mechanismen abnormaler TDP-43 Phasenübergänge und ihre pathologischen Konsequenzen in Neuronen und Gliazellen (Antragstellerinnen / Antragsteller Dormann, Dorothee ; Ninkovic, Jovica )
- Molekulare Mechanismen der funktionalen Phasentrennung in eukaryontischer Gentranskription (Antragsteller Cramer, Patrick ; Söding, Johannes ; Zweckstetter, Markus )
- Molekulare Mechanismen der funktionell relevanten Ausbildung getrennter Phasen für die Biogenese von siRNAs durch Drosophila Loqs, Ago2 und dsRNA (Antragsteller Förstemann, Klaus ; Sattler, Michael )
- Molekulare Mechanismen der Kondensat-Membran Interaktion und wechselseitigen Umformung (Antragsteller Agudo-Canalejo, Jaime ; Knorr, Roland L. )
- Molekulare Mechanismen und funktionelle Implikationen der Ded1p- Phasentrennung. (Antragsteller Sprangers, Remco )
- Molekulare Mechanismen und physiologische Funktionen von DNA-Schadenskondensaten (Antragsteller Alberti, Simon ; Seidel, Claus )
- Molekulare und Zellulaere Determinanten der Kondensation von Tau Proteinen in Dichte Fluessige Phasen (Antragstellerinnen / Antragsteller Betzel, Christian ; Mandelkow, Eckhard ; Wegmann, Ph.D., Susanne )
- Phasentrennung in PML-Kernkörperchen durch ein multivalentes poly-SUMO-2/3-Netzwerk ist für eine effiziente DNA-Rekombination und -Reparatur notwendig (Antragsteller Dittrich, Peter ; Hemmerich, Peter )
- Phasentrennung von Ki-67 beim Austritt aus der Mitose (Antragstellerin Cuylen-Häring, Sara )
- Phasentrennung von membrangebunden Proteinen als Mechanismus zur Bildung der Zonula Occludens (Tight Junction) (Antragsteller Honigmann, Alf ; Weber, Christoph )
- Phasentrennung von ribosomalen Proteinen in der Ribosomenbiogenese und neurologischen Ribosomopathien (Antragstellerinnen / Antragsteller Kraushar, Ph.D., Matthew ; Nikolay, Rainer ; Wegmann, Ph.D., Susanne )
- Post-translationale Kontrolle von Genexpressionsvariabilität durch Flüssig-Flüssig Phasentrennung (Antragsteller Hyman, Anthony A. ; Zechner, Christoph )
- Rolle von submembranösen Phasen Trennung in der Regulation von Myelin- Struktur und Funktion (Antragsteller Simons, Mikael Jakob )
- Studien der Kernporen ähnlichen Permeabilitäts-Eigenschaften von phasenseparierten, flüssigen FG Nucleoporin Kondensaten (Antragsteller Lemke, Edward A. ; Michels, Ph.D., Jasper ; Parekh, Sapun )
- Temperaturabhängige Phasentrennung von RNA-bindenden Proteinen in Chloroplasten (Antragsteller Sattler, Michael ; Schmitz-Linneweber, Christian )
Sprecher
Professor Dr. Edward A. Lemke