Quantenchemische Untersuchungen epigenetisch relevanter Enzymmechanismen (C04)

• Fachliche Zuordnung: Theoretische Chemie: Elektronenstruktur, Dynamik, Simulation
• Förderung: Förderung seit 2018
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 325871075

Ziel des vorliegenden Projektes ist die Berechnung regulatorischer Mechanismen von modifizierten t-RNA-Basen und Proteinen mittels hoch-effizienter linear-skalierender quantenchemischer (QM) Methoden, auch im Rahmen der QM/MM-Näherung. Unsere schnellen QM-Methoden erlauben dabei nicht nur die Beschreibung großer Teile der Enzyme auf QM-Niveau, sondern auch die Beschreibung von Moleküldynamik auf Ab-initio-Niveau. Die Reaktionspfade einschließlich der Freien Energie werden systematisch berechnet, unterstützt durch unsere 'machine-learning' basierte Vorauswahl geeigneter Startstrukturen. Insgesamt erlauben diese Methoden wichtige und zuverlässige Einblicke zur Beschreibung epigenetisch-relevanter Reaktionen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1309: Chemische Biologie epigenetischer Modifikationen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Christian Ochsenfeld