Antikörper-basierte Quantifizierung spezifischer Zytostatika-DNA-Addukte in experimentellen Zellsystemen und in klinischem Probenmaterial

• Antragsteller: Professor Dr. Michael Linscheid; Privatdozent Dr. Jürgen Thomale
• Fachliche Zuordnung: Analytische Chemie
• Förderung: Förderung von 2007 bis 2015
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 38498505

• Erstellungsjahr: 2015

Zusammenfassung der Projektergebnisse

In der Zusammenfassung können wir festhalten, dass wir in den zurückliegen Jahren eine Vielzahl von Ergebnissen erhalten haben, die neues Licht auf die Interaktion von Cis-Platin mit DNA werfen. Die Erkenntnisse zu den durchaus komplexen Adduktspektren und den detailreichen , z.T. überraschenden Ergebnissen zur Reparatur von Crosslinks zeigen, dass wir den richtigen Ansatz und auch die richtigen Methoden entwickelt haben (z. LC/ICP MS und Isotopenverdünnung). Hinzu kommt, dass wir auch nach Auslaufen der Förderung noch weiterhin die vollständige Struktur des Antikörpers untersuchen und dazu die Sequenz der DNA bestimmt haben sowie die Proteinsequenz inclusive der Glycanstrukturen analysieren; auch die Wechselwirkung der modifizierten DNA mit dem Antikörper ist Gegenstand der Untersuchungen, und mittels nativer ESI MS konnte wir die Komplexe massenspektrometrisch sichtbar machen.

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

• Separation and characterization of oxaliplatin dinucleotides from DNA using HPLC-ESI ion trap mass spectrometry, Anal. Bioanal. Chem., 2008, 392(5): 819
  S. Mowaka, M. Linscheid
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00216-008-2311-6)
• Chlorambucil-Adducts in DNA analyzed at the Oligonucleotide Level using HPLC-ESI MS, Chem. Res. Toxicol., 2009, 22(8): 1435
  D. Mohamed, S. Mowaka, J. Thomale, and M.W. Linscheid
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1021/tx900123r)
• Chronic cisplatin treatment promotes enhanced damage repair and tumor progression in a mouse model of lung cancer, Genes Dev, 2010, 24(8), 837-52
  Oliver TG, Mercer KL, Sayles LC, Burke JR, Mendus D, Lovejoy KS, Cheng MH, Subramanian A, Mu D, Powers S, Crowley D, Bronson RT, Whittaker CA, Bhutkar A, Lippard SJ, Golub T, Thomale J, Jacks T, Sweet-Cordero EA
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gad.1897010)
• Differential contributory roles of nucleotide excision and homologous recombination repair for enhancing cisplatin sensitivity in human ovarian cancer cells, Mol Cancer, 2011, 10, 24
  Wang QE, Milum K, Han C, Huang YW, Wani G, Thomale J, Wani AA
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1186/1476-4598-10-24)
• p53 hypersensitivity is the predominant mechanism of the unique responsiveness of testicular germ cell tumor (TGCT) cells to cisplatin. PLoS One. 2011, 6(4):e19198
  Gutekunst M, Oren M, Weilbacher A, Dengler MA, Markwardt C, Thomale J, Aulitzky WE, van der Kuip H
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019198)
• LA-ICP-MS and nHPLC-ESI-LTQ-FT-MS/MS for the analysis of cisplatin-protein complexes separated by two dimensional gel electrophoresis in biological samples, J. Anal. At. Spectrom., 2012, 27, 1474
  E. Moreno-Gordaliza, D. Esteban-Fernández, C. Giesen, K. Lehmann, A. Lázaro, A. Tejedor, C. Scheler, B. Cañas, N. Jakubowski, M. Linscheid and M. Gomez-Gomez
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1039/c2ja30016h)
• On the Complexity and Dynamics of in vivo Cisplatin-DNA Adduct Formation using HPLC/ICP-MS, Metallomics, 2012, 4(10), 1098-1104
  Ziehe M, Esteban-Fernández D, Hochkirch U, Thomale J, Linscheid MW
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1039/c2mt20128c)
• Structures of Oxaliplatin-Oligonucleotide Adducts from DNA, Journal of Mass Spectrometry, 2012, 47(10), 1282-1293
  Mowaka S, Ziehe M, Mohamed D, Hochkirch U, Thomale J, Linscheid MW
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/jms.3080)
• ERCC1 isoform expression and DNA repair in Non-Small Cell Lung Cancer, N Engl J Med, 2013, Mar 21; 368(12): 1101-10
  Friboulet L, Olaussen KA, Pignon JP, Shepherd FA, Tsao MS, Graziano S, Kratzke R, Douillard JY, Seymour L, Pirker R, Filipits M, André F, Solary E, Ponsonnailles F, Robin A, Stoclin A, Dorvault N, Commo F, Vanhecke E, Saulnier P, Thomale J, Le Teuff G, Brambilla E, Soria JC
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1056/NEJMoa1214271)
• Formation and repair kinetics of Pt-(GpG) DNA adducts in extracted circulating tumor cells and response to platinum treatment. Br J Cancer, 2013, 109:1223-9
  Nel I, Gauler TC, Eberhardt WE, Nickel AC, Schuler M, Thomale J, Hoffmann AC
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/bjc.2013.419)
• PARP1 impact on DNA repair of platinum adducts: preclinical and clinical read-outs, Lung Cancer, 2013
  Olaussen KA, Adam J, Vanhecke E, Vielh P, Pirker R, Friboulet L, Popper H, Robin A, Commo F, Thomale J, Kayitalire L, Filipits M, Le Chevalier T, André F, Brambilla E, and Soria JC
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2013.01.014)