Genetische Anpassung von nicht typhoiden Salmonellen im Human- und Tierreservoir in sub-Sahara Afrika

• Antragstellerinnen / Antragsteller: Dr. Denise Dekker; Privatdozent Dr. Daniel Eibach; Professorin Dr. Antje Flieger
• Fachliche Zuordnung: Medizinische Mikrobiologie und Mykologie, Hygiene, Molekulare Infektionsbiologie
• Förderung: Förderung von 2018 bis 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 380545990

Salmonella enterica führt weltweit zu jährlich mehr als 1.2 Milionen Todesfällen. In Industrieländern sind nicht typhoidale Salmonellen (NTS) typischerweise Auslöser einer Gastroenteritis. In vielen Entwicklungsländern hingegen sind NTS die häufigste Sepsisursache bei Erwachsenen wie auch bei Kindern. Während die Übertragung von NTS in Industrieländern überwiegend zoonotisch ist, scheint dieser Übertragungsweg in Sub Sahara Afrika (SSA) keine dominante Rolle einzunehmen. Erste Studien weisen auf eine mögliche anthroponotische Übertragung sowie auf eine Adaption des Erregers auf den Menschen hin, jedoch sind spezifische genetische Adaptionen von NTS in tierischen und Humanen Reservoiren bisher kaum untersucht worden. Primäres Ziel dieser Studie ist die Identifizierung von Salmonella enterica bei gesunden und erkrankten Kindern, sowie bei Tieren um mögliche Erregerreservoire und Anpassung von Salmonellen an den Host mittels genomsequenzierung zu beschreiben. Zusätzlich sollen die Exome von Kindern mit invasiver Salmonellose und deren Eltern auf Risikovarianten hin untersucht werden, um mögliche neue krankheitsrelevante Stoffwechselwege zu identifizieren. Zusammenfassend beinhaltet die Studie folgende Ziele.•Identifizierung von Determinanten im Salmonellengenom welche mit unterschiedlichen Wirten (human, zoonotisch) assoziiert sind•Untersuchung der Exome von Kindern mit invasiver Salmonellose•Untersuchung der sozio-ökonomischen Implikationen von Salmonellosen,•Ausbildung von Afrikanischen Nachwuchsforschern und Etablierung von wissenschaftlichen Netzwerken in SSA.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen
• Internationaler Bezug: Ghana, Tansania
• Mitverantwortliche: Professorin Dr. Linda Falgenhauer; Dr. Angelika Fruth; Dr. Benedikt Hogan; Dr. Can Imirzalioglu; Dr. Ralf Krumkamp, Ph.D.; Wibke Loag; Professor Dr. Jürgen May; Dr. Sandra Simon
• Kooperationspartner: Edwin Liheluka
• ausländ. Mitantragstellerinnen / ausländische Mitantragsteller: Dr. Samwel Gesase; Professor Dr. John Lusingu; Dr. Daniel Minja; Professor Kwasi Obiri-Danso; Dr. Linda Aurelia Ofori; Dr. Nimako Sarpong