Identifizierung des RNA-Protein-Netzwerkes in Makrophagen

• Antragstellerin: Professorin Dr. Antje Ostareck-Lederer
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung ; Biochemie ; Zellbiologie
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 313418556

Zusammenfassung der Projektergebnisse

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Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

• Translation control of TAK1 mRNA by hnRNP K modulates LPS-induced macrophage activation. RNA, 20(6), 899-911.
  Liepelt, Anke; Mossanen, Jana C.; Denecke, Bernd; Heymann, Felix; De Santis, Rebecca; Tacke, Frank; Marx, Gernot; Ostareck, Dirk H. & Ostareck-Lederer, Antje
  
• Identification of RNA-binding Proteins in Macrophages by Interactome Capture. Molecular & Cellular Proteomics, 15(8), 2699-2714.
  Liepelt, Anke; Naarmann-de Vries, Isabel S.; Simons, Nadine; Eichelbaum, Katrin; Föhr, Sophia; Archer, Stuart K.; Castello, Alfredo; Usadel, Björn; Krijgsveld, Jeroen; Preiss, Thomas; Marx, Gernot; Hentze, Matthias W.; Ostareck, Dirk H. & Ostareck-Lederer, Antje
  
• US 9745369 B2 08/29/2017, EP 2855519 B1 11/15/2017: Modulation of the TLR4-signaling pathway
  Ostareck-Lederer, A.; Ostareck, D.H.; Marx, G.; Liepelt A. & Mossanen, J.
  
• RNA-Binding Proteins in the Control of LPS-Induced Macrophage Response. Frontiers in Genetics, 10(c(2019, 2, 4)).
  Ostareck, Dirk H. & Ostareck-Lederer, Antje
  
• Deep and accurate detection of m6A RNA modifications using miCLIP2 and m6Aboost machine learning. Nucleic Acids Research, 49(16), e92-e92.
  Körtel, Nadine; Rücklé, Cornelia; Zhou, You; Busch, Anke; Hoch-Kraft, Peter; Sutandy, F X Reymond; Haase, Jacob; Pradhan, Mihika; Musheev, Michael; Ostareck, Dirk; Ostareck-Lederer, Antje; Dieterich, Christoph; Hüttelmaier, Stefan; Niehrs, Christof; Rausch, Oliver; Dominissini, Dan; König, Julian & Zarnack, Kathi
  
• Methylated HNRNPK acts on RPS19 to regulate ALOX15 synthesis in erythropoiesis. Nucleic Acids Research, 49(6), 3507-3523.
  Naarmann-de Vries, Isabel S; Senatore, Roberta; Moritz, Bodo; Marx, Gernot; Urlaub, Henning; Niessing, Dierk; Ostareck, Dirk H & Ostareck-Lederer, Antje
  
• P23 Acts as Functional RBP in the Macrophage Inflammation Response. Frontiers in Molecular Biosciences, 8(c(2021, 6, 11)).
  de Vries, Sebastian; Benes, Vladimir; Naarmann-de Vries, Isabel S.; Rücklé, Cornelia; Zarnack, Katharina; Marx, Gernot; Ostareck, Dirk H. & Ostareck-Lederer, Antje