Transcriptional definition of cell phenotype and immune function in vitro and in vivo (Z05*)

• Subject Area: Immunology
• Term: from 2014 to 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 15477770

Die Charakterisierung von Immunzellen mittels genomweiter Technologien wird zunehmend wichtiger um neue Zelltypen oder -subtypen zu definieren oder neue Funktionen bekannter Zellen im lokalen Mikromilieu zu bestimmen. Immunregulatorische Mechanismen sind fast ausschließlich transkriptionell definiert. Wir haben deshalb in die Entwicklung neuer Technologien wie RNA-Seq, ChIP-Seq, oder miRNA-Seq und deren Analyse investiert. Zudem werden wir unser bioinformatisches Repertoire um Techniken wie Weighted Coexpression Network Construction, Modular Analysis, Differential Connectivity, oder Context-Specific Neighbor Identification erweitern, um die analytischen Möglichkeiten für Kooperationsprojekte im SFB weiter zu verbessern.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 704: Molecular Mechanisms and Chemical Modulation of Local Immune Regulation
• Major Instrumentation: Upgrade DNA-Sequenzierer
• Instrumentation Group: 3150 DNA-Sequenzer
• Applicant Institution: Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn
• Project Head: Professor Dr. Joachim L. Schultze