Transkriptionelle Definition von Zellphänotypen und Immunfunktionen in vitro und in vivo (Z05*)

• Fachliche Zuordnung: Immunologie
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 15477770

Die Charakterisierung von Immunzellen mittels genomweiter Technologien wird zunehmend wichtiger um neue Zelltypen oder -subtypen zu definieren oder neue Funktionen bekannter Zellen im lokalen Mikromilieu zu bestimmen. Immunregulatorische Mechanismen sind fast ausschließlich transkriptionell definiert. Wir haben deshalb in die Entwicklung neuer Technologien wie RNA-Seq, ChIP-Seq, oder miRNA-Seq und deren Analyse investiert. Zudem werden wir unser bioinformatisches Repertoire um Techniken wie Weighted Coexpression Network Construction, Modular Analysis, Differential Connectivity, oder Context-Specific Neighbor Identification erweitern, um die analytischen Möglichkeiten für Kooperationsprojekte im SFB weiter zu verbessern.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 704: Molekulare Mechanismen und chemische Modulation der lokalen Immunregulation
• Großgeräte: Upgrade DNA-Sequenzierer
• Gerätegruppe: 3150 DNA-Sequenzer
• Antragstellende Institution: Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Joachim L. Schultze