Digitalisierung / Erschließung von Objekten: Towards an integrative and comprehensive standard for meta-omics data of collection objects (MOD-CO)

• Antragstellerinnen / Antragsteller: Professor Dr. Frank Oliver Glöckner; Professor Dr. Gerhard Rambold; Dr. Dagmar Triebel
• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Mikrobielle Ökologie und Angewandte Mikrobiologie
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 248069971

Für die Hinterlegung molekularer Sequenz- und Arraydaten existiert bereits eine Anzahl von Standards. Jedoch fehlt ein umfassend ausgearbeiteter Standard (Schema, Vokabularien) für die Zuordnung aller Arten von -omics-Daten zu Belegmaterial in naturhistorischen Sammlungen und Kultursammlungen. Ziel des Projektes ist es, relevante Deskriptoren aus einer Vielzahl von Analyseprotokollen zu extrahieren um auf dem Hintergrund der verschiedenartigen Methoden eine Standardisierung zu erreichen und dabei eine strukturelle Redundanz zu vermeiden. Des Weiteren sollen relevante Deskriptoren aus verschiedenen anderen Datendomänen exzerpiert und dem neuen konzeptionellen Schema zugeordnet werden. Basierend auf existierenden Konzepten und Standards sollen integrative, kontrollierte Vokabularien erarbeitet werden, um das gesamte Spektrum von Beobachtungs- und Messdaten wie auch die prozeduralen Schritte im Zusammenhang mit einer meta-omics- Charakterisierung von Umweltproben zu beschreiben. Schema und Vokabularien werden beispielhaft in den beiden Datenmanagement-Systemen Diversity Workbench und SILVA/megx.net implementiert und in Zusammenarbeit mit den TDWG- und GSC-Komitees zur Standardisierung veröffentlicht.

• DFG-Verfahren: Digitalisierung und Erschließung (Wiss. Literaturversorgung und Informationssysteme)