Interaktion von RNA Pol II CTD mit Chromatin - Crosstalk zwischen den Codes (A08)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung von 2013 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 213249687

Wir haben eine kombinierte genetisch-massenspektrometrische Methode entwickelt, um die 240 Phosphorylierungsstellen in der CTD von Pol II zu untersuchen. Die Methode liefert Information über die Art und Position jeder einzelnen Modifikation in CTD. Wir verwenden zudem analog-sensitive Kinasen (asCdk7, asCdk8, asCdk9, asCdk12), um die heptad-spezifische Phosphorylierung der CTD durch Kinasen zu bestimmen. Mit Hilfe von Mutanten untersuchen wir die heptad-spezifische Bindung zellulärer Faktoren wie Mediator und Integrator an CTD in vivo. Unser Ziel ist es, die dynamischen Veränderungen in Chromatin und Transkriptionsmaschinerie für Genexpression besser zu verstehen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1064: Chromatindynamik
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Dirk Eick