DNA-methylation pattern formation: mechanistic analysis and mathematical modeling of epigenetic control (C02)

• Subject Area: Statistical Physics, Nonlinear Dynamics, Complex Systems, Soft and Fluid Matter, Biological Physics
• Term: from 2013 to 2016
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 200049484

Epigenetische Kontrolle der Genexpression erfolgt durch die Bildung von DNA-Methylierungsmustern, die in nicht-Gleichgewichtszuständen existieren. Wir werden die DNA-Methylierungsmuster definierter in vivo Maus-Modelle mit Hilfe von Tiefensequenzierung bestimmen und die Daten für Markov Modellierung von diskreten Zuständen nutzen. Darüber hinaus werden wir die epigenetische Kontrolle von Genen die die der ersten Zellbestimmungen festlegen analysieren und Effekte lokaler DNA-Musterbildung auf DNA-Hybridstabilität und auf sequenz-spezifische Proteinbindung bestimmen (mit C1).

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 1027: Physical Modelling of Non-Equilibrium Processes in Biological Systems
• Applicant Institution: Universität des Saarlandes
• Project Heads: Professor Dr. Jörn E. Walter; Professorin Dr. Verena Wolf