DNA-Methylierungs-Muster-Bildung: mechanistische Analyse und mathematische Modellierung epigenetischer Kontrolle (C02)

• Fachliche Zuordnung: Statistische Physik, Nichtlineare Dynamik, Komplexe Systeme, Weiche und fluide Materie, Biologische Physik
• Förderung: Förderung von 2013 bis 2016
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 200049484

Epigenetische Kontrolle der Genexpression erfolgt durch die Bildung von DNA-Methylierungsmustern, die in nicht-Gleichgewichtszuständen existieren. Wir werden die DNA-Methylierungsmuster definierter in vivo Maus-Modelle mit Hilfe von Tiefensequenzierung bestimmen und die Daten für Markov Modellierung von diskreten Zuständen nutzen. Darüber hinaus werden wir die epigenetische Kontrolle von Genen die die der ersten Zellbestimmungen festlegen analysieren und Effekte lokaler DNA-Musterbildung auf DNA-Hybridstabilität und auf sequenz-spezifische Proteinbindung bestimmen (mit C1).

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1027: Physikalische Modellierung von Nichtgleichgewichtsprozessen in biologischen Systemen
• Antragstellende Institution: Universität des Saarlandes
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Jörn E. Walter; Professorin Dr. Verena Wolf