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EXC 1028:  Exzellenzcluster für Pflanzenwissenschaften - Von komplexen Eigenschaften zu synthetischen Modulen

Fachliche Zuordnung Pflanzenwissenschaften
Förderung Förderung von 2012 bis 2018
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 194465578
 
Erstellungsjahr 2019

Zusammenfassung der Projektergebnisse

Pflanzen und Algen ermöglichen das Leben auf der Erde durch die Umwandlung von Sonnenenergie, Wasser und CO2 in chemische Energie. Vor allem Nutzpflanzen stellen die Grundlage der menschlichen Zivilisationen dar. Die Anbauflächen werden jedoch knapper, Ressourcen wie Wasser und Dünger sind endlich. Die Folgen des menschengemachten Klimawandels und einer stetig wachsenden Weltbevölkerung stellen eine große Herausforderung für die Ernährungssicherung dar. Diese verlangen innovative Strategien für eine nachhaltige Pflanzenproduktion, die auf einem Verständnis darüber basieren, wie Pflanzen sich an ihre Umwelt anpassen und mit umweltbedingten Einschränkungen zurechtkommen. Die Antworten auf diese Fragen liegen in der natürlichen und künstlich herbeigeführten genetischen Variation die es Pflanzen und ihren Mikroben ermöglicht, beinahe alle Lebensräume der Erde zu besiedeln. Das Ziel des Exzellenzclusters für Pflanzenwissenschaften CEPLAS war, diese Information für vier komplexe Pflanzenmerkmale, die entscheidend für ein ressourcen-effizientes Wachstum sind, zu entschlüsseln: (A) Ein- und Mehrjährigkeit, (B) C4 Photosynthese, (C) Molekulare und (D) Stoffwechselbedingte Interkationen zwischen Pflanzen und Mikroben. CEPLAS I brachte die wissenschaftlichen Fähigkeiten der Region Köln-Düsseldorf in einem einzigartigen, interdisziplinären Konsortium aus experimentellen und theoretischen Biolog*innen zusammen. Durch die Nutzung quantitativer Genetik und Genomik, computerbasierter Modellierung und pflanzlicher Biochemie sowie von Methoden der Sequenzierung und der Kultivierung von Mikroben, konnten die Wissenschaftler*innen die genetischen Mechanismen der Ein- und Mehrjährigkeit, der evolutiven Entwicklung von C3 zu C4 Photosynthese und der komplexen Zusammensetzung des Pflanzen-assoziierten Mikrobioms entschlüsseln. Dabei wurden wichtige Ressourcen geschaffen, wie z.B. eine Bakterienkollektion, die die Mehrheit der mit der Pflanzen assoziierten Bakterien enthält. Der Aufbau personeller Ressourcen beinhaltete die Besetzung von 11 Professuren im Bereich der Pflanzenwissenschaften und Mikrobiologie, sowie der Bioinformatik, der Synthetischen und Theoretischen Biologie. Zwei der Professuren wurden durch Einwerbung renommierter AvH Professuren besetzt. Ein besonderer Erfolg war auch die Einführung des tenure-track Systems für die Besetzung von Nachwuchsprofessuren auf unabhängige Stellen mit definierten Karriereperspektiven. CEPLAS hat ein umfassendes Programm für die Förderung des wissenschaftlichen Nachwuchses aufgebaut, mit einem BSc Studiengang in Quantitativer Biologie, der gemeinsam von den beiden Universitäten angeboten wird, einer Graduiertenschule und einem strukturierten Postdoc-Programm. Darüber hinaus war CEPLAS aktiv in der Öffentlichkeitsarbeit und der politischen Kommunikation, indem eigene Formate der Wissenschaftskommunikation entwickelt wurden, um mit der Gesellschaft sowie relevanten Entscheidungsträgern in Dialog zu treten.

Link zum Abschlussbericht

https://dx.doi.org/10.2314/KXP:1698247036

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

  • (2013) C(4) photosynthesis: from evolutionary analyses to strategies for synthetic reconstruction of the trait. Curr Opin Plant Biol 16(3):315-321
    Denton AK, Simon R, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.pbi.2013.02.013)
  • (2013) Evolution of C4 phosphoenolpyruvate carboxylase: enhanced feedback inhibitor tolerance is determined by a single residue. Mol Plant 6(6):1996-1999
    Paulus JK, Niehus C, Groth G
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1093/mp/sst078)
  • (2013) Evolution of C4 photosynthesis in the genus flaveria: establishment of a photorespiratory CO2 pump. Plant Cell 25(7):2522-2535
    Schulze S, Mallmann J, Burscheidt J, Koczor M, Streubel M, Bauwe H, Gowik U, Westhoff P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.113.114520)
  • (2013) Gene transfer from bacteria and archaea facilitated evolution of an extremophilic eukaryote. Science 339(6124):1207-1210
    Schönknecht G, Chen WH, Ternes CM, Barbier GG, Shrestha RP, Stanke M, Bräutigam A, Baker BJ, Banfield JF, Garavito RM, Carr K, Wilkerson C, Rensing SA, Gagneul D, Dickenson NE, Oesterhelt C, Lercher MJ, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.1231707)
  • (2013) Genome of the red alga Porphyridium purpureum. Nat Commun 4:1941
    Bhattacharya D, Price DC, Chan CX, Qiu H, Rose N, Ball S, Weber AP, Arias MC, Henrissat B, Coutinho PM, Krishnan A, Zauner S, Morath S, Hilliou F, Egizi A, Perrineau MM, Yoon HS
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms2931)
  • (2013) Greater efficiency of photosynthetic carbon fixation due to single amino-acid substitution. Nat Commun 4:1518
    Paulus JK, Schlieper D, Groth G
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms2504)
  • (2013) Light and the E3 ubiquitin ligase COP1/SPA control the protein stability of the MYB transcription factors PAP1 and PAP2 involved in anthocyanin accumulation in Arabidopsis. Plant J 74(4):638-651
    Maier A, Schrader A, Kokkelink L, Falke C, Welter B, Iniesto E, Rubio V, Uhrig JF, Hülskamp M, Hoecker U
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/tpj.12153)
  • (2013) PLGG1, a plastidic glycolate glycerate transporter, is required for photorespiration and defines a unique class of metabolite transporters. Proc Natl Acad Sci USA 110(8):3185-3190
    Pick TR, Bräutigam A, Schulz MA, Obata T, Fernie AR, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1215142110)
  • (2013) Predicting C4 photosynthesis evolution: modular, individually adaptive steps on a Mount Fuji fitness landscape. Cell 153(7):1579-1588
    Heckmann D, Schulze S, Denton A, Gowik U, Westhoff P, Weber AP, Lercher MJ
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2013.04.058)
  • (2013) The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell 25(8):2813-2830
    Cheng S, van den Bergh E, Zeng P, Zhong X, Xu J, Liu X, Hofberger J, de Bruijn S, Bhide AS, Kuelahoglu C, Bian C, Chen J, Fan G, Kaufmann K, Hall JC, Becker A, Bräutigam A, Weber AP, Shi C, Zheng Z, Li W, Lv M, Tao Y, Wang J, Zou H, Quan Z, Hibberd JM, Zhang G, Zhu XG, Xu X, Schranz ME
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.113.113480)
  • (2014) Analysis of a plant complex resistance gene locus underlying immune-related hybrid incompatibility and its occurrence in nature. PLoS Genet 10(12):e1004848
    Alcazar R, von Reth M, Bautor J, Chae E, Weigel D, Koornneef M, Parker JE
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004848)
  • (2014) Auxin represses stomatal development in dark-grown seedlings via Aux/IAA proteins. Development 141(16):3165-3176
    Balcerowicz M, Ranjan A, Rupprecht L, Fiene G, Hoecker U
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1242/dev.109181)
  • (2014) Comparative transcriptome atlases reveal altered gene expression modules between two Cleomaceae C3 and C4 plant species. Plant Cell 26(8):3243-3260
    Külahoglu C, Denton AK, Sommer M, Mass J, Schliesky S, Wrobel TJ, Berckmans B, Gongora-Castillo E, Buell CR, Simon R, De Veylder L, Bräutigam A, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.114.123752)
  • (2014) Evolution of the Phosphoenolpyruvate Carboxylase Protein Kinase Family in C3 and C4 Flaveria spp. Plant Physiol 165(3):1076-1091
    Aldous SH, Weise SE, Sharkey TD, Waldera-Lupa DM, Stühler K, Mallmann J, Groth G, Gowik U, Westhoff P, Arsova B
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1104/pp.114.240283)
  • (2014) Evolutionary conservation of cold-induced antisense RNAs of Flowering Locus C in Arabidopsis thaliana perennial relatives. Nat Commun 5:4457
    Castaings L, Bergonzi S, Albani MC, Kemi U, Savolainen O, Coupland G
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms5457)
  • (2014) Induced and natural variation of promoter length modulates the photoperiodic response of Flowering Locus T. Nat Commun 5:4558
    Liu L, Adrian J, Pankin A, Hu J, Dong X, von Korff M, Turck F
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms5558)
  • (2014) Leaf shape evolution through duplication, regulatory diversification, and loss of a homeobox gene. Science 343(6172):780-783
    Vlad D, Kierzkowski D, Rast MI, Vuolo F, Dello Ioio R, Galinha C, Gan X, Hajheidari M, Hay A, Smith RS, Huijser P, Bailey CD, Tsiantis M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.1248384)
  • (2014) Microbial genome-enabled insights into plant-microorganism interactions. Nat Rev Genet 15(12):797-813
    Guttman DS, McHardy AC, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nrg3748)
  • (2014) Plastid signals and the bundle sheath: mesophyll development in reticulate mutants. Mol Plant 7(1):14-29
    Lundquist PK, Rosar C, Bräutigam A, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1093/mp/sst133)
  • (2014) Quantitative divergence of the bacterial root microbiota in Arabidopsis thaliana relatives. Proc Natl Acad Sci USA 111(2):585-592
    Schlaeppi K, Dombrowski N, Oter RG, Ver Loren van Themaat E, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1321597111)
  • (2014) Short Vegetative Phase reduces gibberellin biosynthesis at the Arabidopsis shoot apex to regulate the floral transition. Proc Natl Acad Sci USA 111(26):E2760-2769
    Andres F, Porri A, Torti S, Mateos J, Romera-Branchat M, Garcia-Martinez JL, Fornara F, Gregis V, Kater MM, Coupland G
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1409567111)
  • (2014) Short-term acclimation of the photosynthetic electron transfer chain to changing light: a mathematical model. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 369(1640):20130223
    Ebenhöh O, Fucile G, Finazzi G, Rochaix JD, Goldschmidt-Clermont M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1098/rstb.2013.0223)
  • (2014) Sorting Nexin1 is required for modulating the trafficking and stability of the Arabidopsis Iron-Regulated Transporter1. Plant Cell 26(3):1294-1307
    Ivanov R, Brumbarova T, Blum A, Jantke AM, Fink-Straube C, Bauer P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.113.116244)
  • (2014) Spatial H2O2 signaling specificity: H2O2 from chloroplasts and peroxisomes modulates the plant transcriptome differentially. Mol Plant 7(7):1191-1210
    Sewelam N, Jaspert N, Van Der Kelen K, Tognetti VB, Schmitz J, Frerigmann H, Stahl E, Zeier J, Van Breusegem F, Maurino VG
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1093/mp/ssu070)
  • (2014) The role of photorespiration during the evolution of C4 photosynthesis in the genus Flaveria. Elife 3:e02478
    Mallmann J, Heckmann D, Bräutigam A, Lercher MJ, Weber AP, Westhoff P, Gowik U
    (Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.02478)
  • (2015) A cop1 spa mutant deficient in COP1 and SPA proteins reveals partial co-action of COP1 and SPA during Arabidopsis post-embryonic development and photomorphogenesis. Mol Plant 8(3):479-481
    Ordonez-Herrera N, Fackendahl P, Yu X, Schaefer S, Koncz C, Hoecker U
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molp.2014.11.026)
  • (2015) A FYVE zinc finger domain protein specifically links mRNA transport to endosome trafficking. Elife 4
    Pohlmann T, Baumann S, Haag C, Albrecht M, Feldbrügge M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.06041)
  • (2015) A receptor pair with an integrated decoy converts pathogen disabling of transcription factors to immunity. Cell 161(5):1074-1088
    Le Roux C, Huet G, Jauneau A, Camborde L, Tremousaygue D, Kraut A, Zhou B, Levaillant M, Adachi H, Yoshioka H, Raffaele S, Berthome R, Coute Y, Parker JE, Deslandes L
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.04.025)
  • (2015) A reductionist approach to model photosynthetic self-regulation in eukaryotes in response to light. Biochem Soc Trans 43(6):1133-1139
    Matuszyńska A, Ebenhöh O
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1042/BST20150136)
  • (2015) A Secreted Effector Protein of Ustilago maydis Guides Maize Leaf Cells to Form Tumors. Plant Cell 27(4):1332-1351
    Redkar A, Hoser R, Schilling L, Zechmann B, Krzymowska M, Walbot V, Doehlemann G
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.114.131086)
  • (2015) Convergent losses of decay mechanisms and rapid turnover of symbiosis genes in mycorrhizal mutualists. Nat Genet 47(4):410-415
    Kohler A, Kuo A, Nagy LG, Morin E, Barry KW, Buscot F, Canbäck B, Choi C, Cichocki N, Clum A, Colpaert J, Copeland A, Costa MD, Dore J, Floudas D, Gay G, Girlanda M, Henrissat B, Herrmann S, Hess J, Högberg N, Johansson T, Khouja HR, LaButti K, Lahrmann U, Levasseur A, Lindquist EA, Lipzen A, Marmeisse R, Martino E, Murat C, Ngan CY, Nehls U, Plett JM, Pringle A, Ohm RA, Perotto S, Peter M, Riley R, Rineau F, Ruytinx J, Salamov A, Shah F, Sun H, Tarkka M, Tritt A, Veneault-Fourrey C, Zuccaro A, Mycorrhizal Genomics Initiative C, Tunlid A, Grigoriev IV, Hibbett DS, Martin F
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ng.3223)
  • (2015) CUL4 forms an E3 ligase with COP1 and SPA to promote light-induced degradation of PIF1. Nat Commun 6:7245
    Zhu L, Bu Q, Xu X, Paik I, Huang X, Hoecker U, Deng XW, Huq E
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms8245)
  • (2015) Functional overlap of the Arabidopsis leaf and root microbiota. Nature 528(7582):364-369
    Bai Y, Müller DB, Srinivas G, Garrido-Oter R, Potthoff E, Rott M, Dombrowski N, Münch PC, Spaepen S, Remus-Emsermann M, Hüttel B, McHardy AC, Vorholt JA, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature16192)
  • (2015) Genome expansion of Arabis alpina linked with retrotransposition and reduced symmetric DNA methylation. Nat Plants 1(2):14023
    Willing EM, Rawat V, Mandakova T, Maumus F, James GV, Nordstrom KJ, Becker C, Warthmann N, Chica C, Szarzynska B, Zytnicki M, Albani MC, Kiefer C, Bergonzi S, Castaings L, Mateos JL, Berns MC, Bujdoso N, Piofczyk T, de Lorenzo L, Barrero-Sicilia C, Mateos I, Piednoel M, Hagmann J, Chen-Min-Tao R, Iglesias-Fernandez R, Schuster SC, Alonso-Blanco C, Roudier F, Carbonero P, Paz-Ares J, Davis SJ, Pecinka A, Quesneville H, Colot V, Lysak MA, Weigel D, Coupland G, Schneeberger K
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/NPLANTS.2014.23)
  • (2015) Global Transcriptome Profiling of Developing Leaf and Shoot Apices Reveals Distinct Genetic and Environmental Control of Floral Transition and Inflorescence Development in Barley. Plant Cell 27(9):2318-2334
    Digel B, Pankin A, von Korff M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.15.00203)
  • (2015) Heterochrony underpins natural variation in Cardamine hirsuta leaf form. Proc Natl Acad Sci USA 112(33):10539-10544
    Cartolano M, Pieper B, Lempe J, Tattersall A, Huijser P, Tresch A, Darrah PR, Hay A, Tsiantis M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1419791112)
  • (2015) Identification of the transporter responsible for sucrose accumulation in sugar beet taproots. Nat Plants 1:14001
    Jung B, Ludewig F, Schulz A, Meissner G, Wostefeld N, Flügge UI, Pommerrenig B, Wirsching P, Sauer N, Koch W, Sommer F, Muhlhaus T, Schroda M, Cuin TA, Graus D, Marten I, Hedrich R, Neuhaus HE
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/NPLANTS.2014.1)
  • (2015) Immune responses: Photosynthetic defence. Nat Plants 1(6):15079
    Göhre V
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nplants.2015.79)
  • (2015) Mathematical modelling of the diurnal regulation of the MEP pathway in Arabidopsis. New Phytol 206(3):1075-1085
    Pokhilko A, Bou-Torrent J, Pulido P, Rodriguez-Concepcion M, Ebenhöh O
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/nph.13258)
  • (2015) Metabolic connectivity as a driver of host and endosymbiont integration. Proc Natl Acad Sci USA 112(33):10208-10215
    Karkar S, Facchinelli F, Price DC, Weber AP, Bhattacharya D
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1421375112)
  • (2015) Microbiota and Host Nutrition across Plant and Animal Kingdoms. Cell Host Microbe 17(5):603-616
    Hacquard S, Garrido-Oter R, Gonzalez A, Spaepen S, Ackermann G, Lebeis S, McHardy AC, Dangl JL, Knight R, Ley R, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.chom.2015.04.009)
  • (2015) Mutualistic root endophytism is not associated with the reduction of saprotrophic traits and requires a noncompromised plant innate immunity. New Phytol 207(3):841-857
    Lahrmann U, Strehmel N, Langen G, Frerigmann H, Leson L, Ding Y, Scheel D, Herklotz S, Hilbert M, Zuccaro A
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/nph.13411)
  • (2015) phenoVein-A Tool for Leaf Vein Segmentation and Analysis. Plant Physiol 169(4):2359-2370
    Bühler J, Rishmawi L, Pflugfelder D, Huber G, Scharr H, Hülskamp M, Koornneef M, Schurr U, Jahnke S
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1104/pp.15.00974)
  • (2015) Real-time dynamics of peptide ligand-dependent receptor complex formation in planta. Sci Signal 8(388):ra76
    Somssich M, Ma Q, Weidtkamp-Peters S, Stahl Y, Felekyan S, Bleckmann A, Seidel CA, Simon R
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1126/scisignal.aab0598)
  • (2015) Redesigning photosynthesis to sustainably meet global food and bioenergy demand. Proc Natl Acad Sci USA 112(28):8529-8536.
    Ort DR, Merchant SS, Alric J, Barkan A, Blankenship RE, Bock R, Croce R, Hanson MR, Hibberd JM, Long SP, Moore TA, Moroney J, Niyogi KK, Parry MA, Peralta-Yahya PP, Prince RC, Redding KE, Spalding MH, van Wijk KJ, Vermaas WF, von Caemmerer S, Weber AP, Yeates TO, Yuan JS, Zhu XG
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1424031112)
  • (2015) Structure and function of the bacterial root microbiota in wild and domesticated barley. Cell Host Microbe 17(3):392-403
    Bulgarelli D, Garrido-Oter R, Münch PC, Weiman A, Dröge J, Pan Y, McHardy AC, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.chom.2015.01.011)
  • (2016) A mathematical model of nonphotochemical quenching to study short-term light memory in plants. Biochim Biophys Acta 1857(12):1860-1869
    Matuszyńska A, Heidari S, Jahns P, Ebenhöh O
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2016.09.003)
  • (2016) Adaptive evolution of complex innovations through stepwise metabolic niche expansion. Nat Commun 7:11607
    Szappanos B, Fritzemeier J, Csorgo B, Lazar V, Lu X, Fekete G, Balint B, Herczeg R, Nagy I, Notebaart RA, Lercher MJ, Pal C, Papp B
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms11607)
  • (2016) CLAVATA-WUSCHEL signaling in the shoot meristem. Development 143(18):3238-3248
    Somssich M, Je BI, Simon R, Jackson D
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1242/dev.133645)
  • (2016) Energy efficiency trade-offs drive nucleotide usage in transcribed regions. Nat Commun 7:11334
    Chen WH, Lu G, Bork P, Hu S, Lercher MJ
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms11334)
  • (2016) Evolution. Pathogen to powerhouse. Science 351(6274):659-660
    Ball SG, Bhattacharya D, Weber AP
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.aad8864)
  • (2016) Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida. Nat Plants 2(6):16074
    Bombarely A, Moser M, Amrad A, Bao M, Bapaume L, Barry CS, Bliek M, Boersma MR, Borghi L, Bruggmann R, Bucher M, D'Agostino N, Davies K, Druege U, Dudareva N, Egea-Cortines M, Delledonne M, Fernandez-Pozo N, Franken P, Grandont L, Heslop- Harrison JS, Hintzsche J, Johns M, Koes R, Lv X, Lyons E, Malla D, Martinoia E, Mattson NS, Morel P, Mueller LA, Muhlemann J, Nouri E, Passeri V, Pezzotti M, Qi Q, Reinhardt D, Rich M, Richert-Poggeler KR, Robbins TP, Schatz MC, Schranz ME, Schuurink RC, Schwarzacher T, Spelt K, Tang H, Urbanus SL, Vandenbussche M, Vijverberg K, Villarino GH, Warner RM, Weiss J, Yue Z, Zethof J, Quattrocchio F, Sims TL, Kuhlemeier C
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/NPLANTS.2016.74)
  • (2016) Pinpointing genes underlying annual/perennial transitions with comparative genomics. BMC Genomics 17(1):921
    Heidel AJ, Kiefer C, Coupland G, Rose LE
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1186/s12864-016-3274-1)
  • (2016) Pipecolic Acid Orchestrates Plant Systemic Acquired Resistance and Defense Priming via Salicylic Acid-Dependent and -Independent Pathways. Plant Cell 28(1):102-129
    Bernsdorff F, Döring AC, Gruner K, Schuck S, Bräutigam A, Zeier J
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.15.00496)
  • (2016) Regulation of Pathogen-Triggered Tryptophan Metabolism in Arabidopsis thaliana by MYB Transcription Factors and Indole Glucosinolate Conversion Products. Mol Plant 9(5):682-695
    Frerigmann H, Pislewska-Bednarek M, Sanchez-Vallet A, Molina A, Glawischnig E, Gigolashvili T, Bednarek P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molp.2016.01.006)
  • (2016) Root nodule symbiosis in Lotus japonicus drives the establishment of distinctive rhizosphere, root, and nodule bacterial communities. Proc Natl Acad Sci USA 113(49):E7996-E8005
    Zgadzaj R, Garrido-Oter R, Jensen DB, Koprivova A, Schulze-Lefert P, Radutoiu S
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1616564113)
  • (2016) StrigoQuant: A genetically encoded biosensor for quantifying strigolactone activity and specificity. Sci Adv 2(11):e1601266
    Samodelov SL, Beyer HM, Guo X, Augustin M, Jia KP, Baz L, Ebenhöh O, Beyer P, Weber W, Al-Babili S, Zurbriggen MD
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1126/sciadv.1601266)
  • (2016) Survival trade-offs in plant roots during colonization by closely related beneficial and pathogenic fungi. Nat Commun 7:11362
    Hacquard S, Kracher B, Hiruma K, Munch PC, Garrido-Oter R, Thon MR, Weimann A, Damm U, Dallery JF, Hainaut M, Henrissat B, Lespinet O, Sacristan S, Ver Loren van Themaat E, Kemen E, McHardy AC, Schulze-Lefert P, O'Connell RJ
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms11362)
  • (2016) The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity. Nat Plants 2(11):16167
    Gan X, Hay A, Kwantes M, Haberer G, Hallab A, Ioio RD, Hofhuis H, Pieper B, Cartolano M, Neumann U, Nikolov LA, Song B, Hajheidari M, Briskine R, Kougioumoutzi E, Vlad D, Broholm S, Hein J, Meksem K, Lightfoot D, Shimizu KK, Shimizu-Inatsugi R, Imprialou M, Kudrna D, Wing R, Sato S, Huijser P, Filatov D, Mayer KF, Mott R, Tsiantis M
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/NPLANTS.2016.167)
  • (2016) The Evolutionarily Conserved Protein Photosynthesis Affected Mutant71 Is Required for Efficient Manganese Uptake at the Thylakoid Membrane in Arabidopsis. Plant Cell 28(4):892-910
    Schneider A, Steinberger I, Herdean A, Gandini C, Eisenhut M, Kurz S, Morper A, Hoecker N, Ruhle T, Labs M, Flügge UI, Geimer S, Schmidt SB, Husted S, Weber AP, Spetea C, Leister D
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.15.00812)
  • (2016) The fungal-specific beta-glucan-binding lectin FGB1 alters cell-wall composition and suppresses glucan-triggered immunity in plants. Nat Commun 7:13188
    Wawra S, Fesel P, Widmer H, Timm M, Seibel J, Leson L, Kesseler L, Nostadt R, Hilbert M, Langen G, Zuccaro A
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms13188)
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    Schmitz J, Dittmar IC, Brockmann JD, Schmidt M, Hüdig M, Rossoni AW, Maurino VG
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    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41477-018-0116-y)
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    Abbas M, Hernandez-Garcia J, Pollmann S, Samodelov SL, Kolb M, Friml J, Hammes UZ, Zurbriggen MD, Blazquez MA, Alabadi D
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    Jacoby RP, Martyn A, Kopriva S
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  • (2018) Experimental noise cutoff boosts inferability of transcriptional networks in large-scale gene-deletion studies. Nat Commun 9(1):133
    Blum CF, Heramvand N, Khonsari AS, Kollmann M
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  • (2018) Flavin Monooxygenase- Generated N-Hydroxypipecolic Acid Is a Critical Element of Plant Systemic Immunity. Cell 173(2):456-469 e416
    Hartmann M, Zeier T, Bernsdorff F, Reichel-Deland V, Kim D, Hohmann M, Scholten N, Schuck S, Bräutigam A, Holzel T, Ganter C, Zeier J
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.049)
  • (2018) Natural variation in stomata size contributes to the local adaptation of water-use efficiency in Arabidopsis thaliana. Mol Ecol 27(20):4052-4065
    Dittberner H, Korte A, Mettler-Altmann T, Weber APM, Monroe G, de Meaux J
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    van der Linde K, Timofejeva L, Egger RL, Ilau B, Hammond R, Teng C, Meyers BC, Doehlemann G, Walbot V
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    Sapp M, Ploch S, Fiore-Donno AM, Bonkowski M, Rose LE
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    Misas Villamil JC, Mueller AN, Demir F, Meyer U, Ökmen B, Schulze Hüynck J, Breuer M, Dauben H, Win J, Huesgen PF, Doehlemann G
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  • (2019) A Growth-Based Framework for Leaf Shape Development and Diversity. Cell 177(6):1405-1418 e1417
    Kierzkowski D, Runions A, Vuolo F, Strauss S, Lymbouridou R, Routier-Kierzkowska AL, Wilson-Sanchez D, Jenke H, Galinha C, Mosca G, Zhang Z, Canales C, Dello Ioio R, Huijser P, Smith RS, Tsiantis M
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    Hyun Y, Vincent C, Tilmes V, Bergonzi S, Kiefer C, Richter R, Martinez-Gallegos R, Severing E, Coupland G
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    Voiniciuc C, Dama M, Gawenda N, Stritt F, Pauly M
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  • (2019) Molecular adaptations of NADP-malic enzyme for its function in C4 photosynthesis in grasses. Nat Plants 5(7):755-765
    Alvarez CE, Bovdilova A, Hoppner A, Wolff CC, Saigo M, Trajtenberg F, Zhang T, Buschiazzo A, Nagel-Steger L, Drincovich MF, Lercher MJ, Maurino VG
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41477-019-0451-7)
  • (2019) Nutrient exchange in arbuscular mycorrhizal symbiosis from a thermodynamic point of view. New Phytol 222(2):1043-1053
    Dreyer I, Spitz O, Kanonenberg K, Montag K, Handrich MR, Ahmad S, Schott-Verdugo S, Navarro-Retamal C, Rubio-Melendez ME, Gomez-Porras JL, Riedelsberger J, Molina- Montenegro MA, Succurro A, Zuccaro A, Gould SB, Bauer P, Schmitt L, Gohlke H
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/nph.15646)
  • (2019) PAPST2 Plays Critical Roles in Removing the Stress Signaling Molecule 3'-Phosphoadenosine 5'-Phosphate from the Cytosol and Its Subsequent Degradation in Plastids and Mitochondria. Plant Cell 31(1):231-249
    Ashykhmina N, Lorenz M, Frerigmann H, Koprivova A, Hofsetz E, Stuhrwohldt N, Flügge UI, Haferkamp I, Kopriva S, Gigolashvili T
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.18.00512)
  • (2019) Rootspecific camalexin biosynthesis controls the plant growth-promoting effects of multiple bacterial strains. Proc Natl Acad Sci USA 116(31):15735-15744
    Koprivova A, Schuck S, Jacoby RP, Klinkhammer I, Welter B, Leson L, Martyn A, Nauen J, Grabenhorst N, Mandelkow JF, Zuccaro A, Zeier J, Kopriva S
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1818604116)
  • (2019) Smut infection of perennial hosts: the genome and the transcriptome of the Brassicaceae smut fungus Thecaphora thlaspeos reveal functionally conserved and novel effectors. New Phytol 222(3):1474-1492
    Courville KJ, Frantzeskakis L, Gul S, Haeger N, Kellner R, Hessler N, Day B, Usadel B, Gupta YK, van Esse HP, Brachmann A, Kemen E, Feldbrügge M, Göhre V
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/nph.15692)
  • (2019) Soil nematode abundance and functional group composition at a global scale. Nature 572(7768):194-198
    van den Hoogen J, Geisen S, Routh D, Ferris H, Traunspurger W, Wardle DA, de Goede RGM, Adams BJ, Ahmad W, Andriuzzi WS, Bardgett RD, Bonkowski M, Campos- Herrera R, Cares JE, Caruso T, de Brito Caixeta L, Chen X, Costa SR, Creamer R, Mauro da Cunha Castro J, Dam M, Djigal D, Escuer M, Griffiths BS, Gutierrez C, Hohberg K, Kalinkina D, Kardol P, Kergunteuil A, Korthals G, Krashevska V, Kudrin AA, Li Q, Liang W, Magilton M, Marais M, Martin JAR, Matveeva E, Mayad EH, Mulder C, Mullin P, Neilson R, Nguyen TAD, Nielsen UN, Okada H, Rius JEP, Pan K, Peneva V, Pellissier L, Carlos Pereira da Silva J, Pitteloud C, Powers TO, Powers K, Quist CW, Rasmann S, Moreno SS, Scheu S, Setala H, Sushchuk A, Tiunov AV, Trap J, van der Putten W, Vestergard M, Villenave C, Waeyenberge L, Wall DH, Wilschut R, Wright DG, Yang JI, Crowther TW
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41586-019-1418-6)
  • (2019) Subfamily-Specific Specialization of RGH1/MLA Immune Receptors in Wild Barley. Mol Plant Microbe Interact 32(1):107-119
    Maekawa T, Kracher B, Saur IML, Yoshikawa-Maekawa M, Kellner R, Pankin A, von Korff M, Schulze-Lefert P
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1094/MPMI-07-18-0186-FI)
  • (2019) The inconspicuous gatekeeper: endophytic Serendipita vermifera acts as extended plant protection barrier in the rhizosphere. New Phytol 224(2):886-901
    Sarkar D, Rövenich H, Jeena G, Nizam S, Tissier A, Balcke GU, Mahdi LK, Bonkowski M, Langen G, Zuccaro A
    (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/nph.15904)
 
 

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