Untersuchungen zum besseren Verständnis und zur Vorhersage der Wechselwirkungen von kleinen Molekülen und Proteinen

• Antragsteller: Professor Dr. Peter Kolb
• Fachliche Zuordnung: Pharmazie
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 180863322

Viele Prozesse in lebendenOrganismen werden durchWechselwirkungen von kleinen Molekülen (“Liganden”)mit Proteinen reguliert. Auch mit pharmazeutischenWirkstoffen wird versucht, Proteine zu stimulieren oder zu hemmen. Das Verständnis und die Vorhersage dieser Wechselwirkungen durch Computermethoden (“docking”) ist Gegenstand dieser Nachwuchsgruppe. Die Bindung eines Liganden an mehrere Proteine kann hohe Wirksamkeit (bei Wechselwirkung mit mehreren krankheitsrelevanten Proteinen) oder schwere Nebenwirkungen (bei Bindung an ungewollte Proteine) bedeuten. Das Hauptaugenmerk der Untersuchungen wird deshalb auf die Spezifit ät der Wechselwirkungen gelegt werden. Das Ziel ist es (I) ein Profil der durch docking vorhergesagtenWechselwirkungen eines Moleküls mit mehreren Kinasen zu erstellen und pharmazeutische Wirkstoffe gegen Kinasen, die in Brustkrebs involviert sind, zu finden; (II) die Bindungstaschen von Kinasen und G-Protein-gekoppelten Rezeptoren mittels docking von molekularen Sonden zu kartographieren und chemische Verbesserungen an Molekülen vorzuschlagen; sowie (III) eine schnelle Methode zur Abschätzung der konformationellen Entropie einer rotierbaren Bindung zu entwickeln um die Vorhersage der Bindungsst ärke eines Liganden zu verbessern.

• DFG-Verfahren: Emmy Noether-Nachwuchsgruppen