Triple-Quadrupol Massenspektrometer

• Subject Area: Basic Research in Biology and Medicine
• Term: Funded in 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 90805599

„Die Core Facility (CF) Metabolomics des Zentrums für Systemanalyse stellt die analytische Infrastruktur für die Identifizierung und Quantifizierung von Metaboliten für die systembiologisch arbeitenden Arbeitsgruppen in Freiburg zur Verfügung. Die beteiligten Arbeitsgruppen arbeiten mit unterschiedlichsten Probenmatrizes von Pflanzen, Tieren und Menschen. Komplementär zu der ebenfalls projektierten PTR-MS/GC-MS Anlage können mit dem Tandem-Quadrupol Massenspektrometer gekoppelt an eine (bereits vorhandene) nano-HPLC (Pumpe und Probengeber) nicht nur verdampfbare, sondern auch eine Vielzahl polarer und geladener Metabolite analysiert werden. Generell ist abzusehen, dass die Arbeitsgruppen, die die Core Facility Metabolomics nutzen werden, hauptsächlich gezielte Analysen von (vor)definierten Metaboliten durchführen werden („targeted approaches“). Hierbei steht die Quantifizierung der Metabolitkonzentrationen wie auch die Quantifizierung der Veränderung von Konzentrationen durch experimentelle Manipulation (Umwelteinflüsse, transgene Linien etc.) im Vordergrund. Das zur Anschaffung geplante Triple Quadrupol Gerät ermöglicht durch die Option des Product- Precursor- und Neutral Loss Scans, zum einen vielfältige Strukturinformation zu erhalten. Zum anderen sind Triple Quadrupol Massenspektrometer die Geräte der Wahl, um quantitative Analysen von Metaboliten durchzuführen. Für die hochsensitive Analyse von noch kleinsten Probenmengen ist die Kopplung einer nano-HPLC an das MS/MS vorgesehen. Für die Erfassung der exakten Masse des Molekülions und der Fragmente des Analyten zur Identifizierung unbekannter Substanzen ist eine Mitnutzung des Q-TOF Massenspektrometers der CF Proteomics vorgesehen. Diese gemeinsame Nutzung wird durch die Ausstattung der MS-Geräte mit einer identischen Chip-HPLC optimiert.“

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
• Leaders: Professor Dr. Arthur Gessler, until 10/2012; Professor Dr. Bernd Kammerer, since 11/2012