TRR 11:
Structure and Function of Membrane Proteins
Fachliche Zuordnung
Biologie
Medizin
Förderung
Förderung von 2003 bis 2008
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5485876
Im Zentrum dieses Sonderforschungsbereichs Transregio steht die Analyse der Struktur und Funktion spezifischer Membranproteine, die in Kollaboration von Wissenschaftlern der Universitäten Zürich und Konstanz erforscht werden.Proteine der Plasmamembran und assoziierte Proteinkomplexe steuern vitale Prozesse und spezifische Reaktionen von Zellen. Sie fungieren durch adäquate Faltung in komplexe 3-dimensionale Strukturen als Pumpen, Kanäle, Transporter, Rezeptoren bzw. bilden spezialisierte Mikrozentren für zellspezifische Reaktionen, Kommunikation zwischen Zellen und Transduktion von Signalen ins Zellinnere. Sie durchspannen die isolierende Lipidschicht oder sind mit der Plasmamembran und weiteren Proteinen assoziiert, wobei sie sich dynamisch zu Multi-Proteinkomplexen (Mikrodomänen) mit Signal übermittelnder Funktion assemblieren.Durch das Zusammenführen der Expertise und des methodisch-technischen know-hows von Wissenschaftlern der Universitäten Zürich (und ETH) und Konstanz sollen die 3-dimensionale Struktur und Mechanismen der Faltung relevanter Membranproteine aufgeklärt und damit verbunden ihre Funktion im Zellgeschehen verstanden werden. Zudem sollen die dynamische Interaktion assoziierter Proteine sowie ihre funktionellen Modifikationen und pathogenetischen Auswirkungen erforscht werden. Hierzu zählen ABC-Transporter und andere spezifische Transportproteine von Prokaryonten und Eukaryonten, Ionenpumpen und Kanäle, spezifische Rezeptoren an Immunzellen, Inhibitoren von Nervenfaserwachstum, Synapsenproteine, Mikrodomänen-Proteine, das zelluläre Prion-Protein und seine pathogene "Scrapie"-Isoform, das Amyloid Precursor Protein und seine pathogene (Alzheimer's) Prozessierungsform.Die drei Bereiche sind:-- Struktur und Funktion von Transportproteinen und Ionen-Pumpen;-- Strukturanalyse und Proteinfaltung;-- Membranproteine mit Funktionen in Zell-Interaktionen und transmembranärer Signaltransduktion.
DFG-Verfahren
Transregios
Internationaler Bezug
Schweiz
Abgeschlossene Projekte
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A01 - Structure and function of prokaryotic binding protein-dependent ABC transporters
(Teilprojektleiter
Boos, Winfried
)
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A06 - Structure and function of membrane proteins: YuaG (reggie-1) and GluP probably involved in cell division and morphology of Bacillus subtilis
(Teilprojektleiter
Boos, Winfried
;
Dahl, Michael
)
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B01 - Kristallisation und Strukturanalyse von aktiven Transportern der Zytoplasmamembran
(Teilprojektleiter
Boos, Winfried
;
Diederichs, Kay
;
Welte, Wolfram
)
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B03 - Faltung integraler Membranproteine in Lipid-Doppelschichten - Effekte von Membrandipoproteinen auf Membranen und auf die Faltung integraler Membranproteine
(Teilprojektleiter
Kleinschmidt, Jörg H.
)
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B05 - 3D-architecture of the multi-ligand receptor RAGE including its functional complexes, and structural analysis of TOXIC PROTEINS involved in neurodegenerative deseases
(Teilprojektleiter
Kroneck, Peter M. H.
)
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B07 - Crystallization and structural analyses of recognition modules from neuronal cell adhesion and receptor molecules
(Teilprojektleiter
Diederichs, Kay
;
Welte, Wolfram
)
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B08 - Struktur und Wechselwirkung von Proteinen, die an neuronalen Entwicklungs- und Signalprozessen sowie an der Reaktion auf zellulären Stress beteiligt sind
(Teilprojektleiter
Möller, Heiko
)
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C02 - Funktionsanalyse von Nogo und Prion Protein
(Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter
Málaga-Trillo, Ph.D., Edward
;
Stürmer, Claudia
)
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C04 - Microdomain calcium signalling in a secretory protozoan cell: Identification and funktional localization of membrane proteins in cortical calcium stores
(Teilprojektleiter
Plattner, Helmut
)
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C06 - Zelluläre Funktion und Dynamik der Reggie Proteine
(Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter
Langhorst, Matthias F.
;
Stürmer, Claudia
)
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C08 - Structure elucidation, molecular degradation pathwas and immunological recognition properties of the ß-amyloid precursor protein APP
(Teilprojektleiter
Przybylski, Ph.D., Michael
)
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C09 - Regulation of CCR7 signalling and lipid raft association in dendritic cells through prostaglandin E2
(Teilprojektleiter
Groettrup, Marcus
;
Legler, Ph.D., Daniel
)
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C10 - Structure and function of the highly conserved TM1 region of prion protein
(Teilprojektleiter
Bürkle, Alexander
)
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C11 - Structural and functional relationships of conserved intramembrane glycoproteases from higher plants and bacteria
(Teilprojektleiterin
Adamska, Iwona
)
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D01 - Mikrodomänen Calcium-Signale in einer sekretorischen Protozoen-Zelle: Identifizierung und funktionelle Lokalisation von Membranproteinen in Kalzium Speichern von Paramecium Zellen
(Teilprojektleiter
Plattner, Helmut
)
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D05 - Strukturelle und funktionalle Verwandtschaft von Reggie/Flotillin-ähnlichen Proteinen und Glykoproteasen in Pro- und Eukaryonten
(Teilprojektleiterinnen
Adamska, Iwona
;
Stürmer, Claudia
)
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D06 - Lokalisierung und intrazelluläre Wanderung des Chemokinrezeptors CCR7 nach ligandeninduzierter Signaltransduktion and Chemotaxis
(Teilprojektleiter
Groettrup, Marcus
;
Legler, Ph.D., Daniel
)
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N01 - Mechanism of Wnt and Planar Cell Polarity Signal Transduction by Frizzled Receptors through Trimeric G-proteins
(Teilprojektleiter
Katanaev, Ph.D., Vladimir L.
)
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N01 - Mechanism of Wnt and Planar Cell Polarity Signal Transduction by Frizzled Receptors through Trimeric G-proteins
(Teilprojektleiter
Katanaev, Ph.D., Vladimir L.
)
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Z - Zentrale Aufgaben
(Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter
Sonderegger, Peter
;
Stürmer, Claudia
)
