SFB 628:
Functional Membrane Proteomics - From Transport Machineries to Dynamic Assemblies and Networks
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung von 2003 bis 2007
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5485691
Die Analyse von Membranproteinen stellt eine der besonderen Herausforderungen der Biowissenschaften und Medizin dar. In der lebenden Zelle sind Membranproteine an vielen grundlegenden Reaktionen beteiligt. So ist jedes dritte menschliche Gen an Membranprozessen, wie der Zell-Zell-Kommunikation, dem Weiterleiten von Signalen, dem Stofftransport und dem Zellaufbau, beteiligt und steht daher im Zentrum der Pharmaforschung. Trotz ihrer überaus großen Zahl ist bislang lediglich die Struktur von weniger als 30 Membranproteinen aus verschiedenen Organismen entschlüsselt worden. Im Rahmen unseres Sonderforschungsbereichs werden die Funktion und die Struktur unterschiedlicher Gruppen von membranassoziierten Protein-Komplexen und -Netzwerken mit einem breiten Spektrum an biochemischen, biophysikalischen, genetischen und zellbiologischen Techniken sowie der Methodik der Proteom-Analyse erforscht. Die Forscher interessieren sich insbesondere dafür, wie komplexe Membrantransportmaschinerien aufgebaut und wie Proteine in der Membran miteinander kommunizieren und in dynamischen Netzwerken organisiert sind. An diesem Forscherverbund sind Gruppen aus den Fachbereichen Biologie und Informatik (3), Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften (6) und Medizin (3) sowie aus den Max-Planck-Instituten für Biophysik (3) und Hirnforschung (1) beteiligt.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Internationaler Bezug
USA
Abgeschlossene Projekte
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A01 - Structure and Function of Arcaeal Membrane Transporters
(Teilprojektleiter
Kühlbrandt, Werner
)
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A02 - Function of the Transport Complex TAP
(Teilprojektleiter
Abele, Rupert
;
Tampé, Robert
)
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A03 - Solid-state NMR on ABC Multidrug Transporter LmrA
(Teilprojektleiter
Glaubitz, Clemens
)
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B01 - Differential Partners and Dynamics of Membrane Protein Shrew-1 in Polarized and Non-Polarized Cells
(Teilprojektleiterin
Starzinski-Powitz, Anna
)
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B02 - Viral and Instrinsic Modulators
(Teilprojektleiter
Tampé, Robert
)
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B04 - Function of Reggie Proteins in Cell Adhesion and Membrane Receptor Trafficking
(Teilprojektleiterin
Tikkanen, Ritva
)
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B05 - Dynamics of Type I Interferon Receptor Assembly
(Teilprojektleiter
Piehler, Jacob
)
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B06 - NMR Investigations of Mammalian Rhodopsin and of Membrane-associated Protein GARP2
(Teilprojektleiter
Schwalbe, Harald
)
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C01 - Structural Membrane Proteomics and Genomics Using the Hyperthermophilic Eubacterium Aquifex aeolicus
(Teilprojektleiter
Michel, Hartmut
)
-
C02 - Characterization of Membrane Protein Complexes
(Teilprojektleiter
Karas, Michael
;
Schägger, Hermann
)
-
C03 - Proteomics of Large Membrane Protein Assemblies: The Accessory Subunits of Mitochondrial Complex I
(Teilprojektleiter
Brandt, Ulrich
)
-
C04 - Structural and Functional Investigation of Membrane Proteins by Combined Approaches of Cell-Free Expression and NMR Spectroscopy
(Teilprojektleiter
Bernhard, Frank
;
Dötsch, Volker
)
-
C05 - Proteomic Analysis of Postsynaptic Receptor Complexes
(Teilprojektleiter
Betz, Heinrich
)
-
C06 - The Synaptic Vesicle Proteome: Identification and Functional Characterization of Novel Constituents
(Teilprojektleiter
Volknandt, Walter
;
Zimmermann, Herbert
)
-
C07 - Functional Analysis of Novel Proteins Associated with Nicotinic Acetylcholine Receptors and Synaptic Vesicles in Caenorhabditis elegans
(Teilprojektleiter
Gottschalk, Alexander
)
-
P04 - Protein Transport Across Biological Membranes - the HlyB/HlyA System from E.coli
(Teilprojektleiter
Schmitt, Lutz
)
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P05 - Structural and Functional Analysis of Protein Translocation
(Teilprojektleiter
Collinson, Ian
)
-
P06 - Molecular Cross Talk at the Endothelial Membrane
(Teilprojektleiter
Müller-Esterl, Werner
)
-
P07 - Funkctional Dynamics of Shrew-1 in Epithelial Adherens Junctions
(Teilprojektleiterin
Starzinski-Powitz, Anna
)
-
P08 - Viral Inhibitors of the Antigen Processing Machinery
(Teilprojektleiter
Tampé, Robert
)
-
P10 - Dynamics of Type I-Interferon Receptor Assembly
(Teilprojektleiter
Piehler, Jacob
)
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P11 - High Resolution Spectroscopy Investigations of T-Cell Activation and G Protein Coupled Receptors
(Teilprojektleiter
Schwalbe, Harald
)
-
P12 - Membrane Proteomics using the Hyperthermophilic Eubacterium Aquifex Aeolicus
(Teilprojektleiter
Michel, Hartmut
)
-
P13 - Characterization of Membrane Protein Complexes
(Teilprojektleiter
Karas, Michael
;
Schägger, Hermann
)
-
P14 - Proteomics of Large Membrane Protein Assemblies: the Accessory Subunits of Mitochondrial Complex I
(Teilprojektleiter
Brandt, Ulrich
)
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P15 - Proteomic Analysis of Postsynaptic Receptor Complexes
(Teilprojektleiter
Betz, Heinrich
;
Kneussel, Ph.D., Matthias
)
-
P16 - The Synaptic Vesicle Proteome under conditions of Rest and Activation
(Teilprojektleiter
Volknandt, Walter
;
Zimmermann, Herbert
)
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P17 - Proteomic and funkctional analysis of pre- and post-synaptic componentes in Caenorhabditis elegans
(Teilprojektleiter
Gottschalk, Alexander
)
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P18 - Strukturelle und funktionelle Analyse integraler Membranproteine
(Teilprojektleiter
Dötsch, Volker
)
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P19 - Functional characterization of the reggie protein family: posttranslational modifications and signaling partners
(Teilprojektleiterin
Tikkanen, Ritva
)
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Z01 - Zentrale Aufgaben
(Teilprojektleiter
Tampé, Robert
)