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SPP 1174:  Deep Metazoan Phylogeny

Subject Area Biology
Term from 2005 to 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5472147
 
Final Report Year 2014

Final Report Abstract

Das Schwerpunktprogramm „Deep Metazoan Phylogeny“ (SPP 1174) führte in einem inhaltlich koordiniertem Forschungsnetzwerk Spezialisten für vergleichende Morphologie, molekulare Phylogenetik und Informatik zusammen, um einerseits die Ursachen von Widersprüchen in Publikationen aufzuklären sowie neue Daten zur Stammesgeschichte der Tiere zu gewinnen. Einige der wesentlichen Fragen zur Stammesgeschichte waren: Welche Tiergruppe steht der Wurzel des Stammbaums am nächsten und repräsentiert die urtümlichste noch lebende Tierform? Sind die Coelomata monophyletisch, ist die neue Gruppierung der Protostomia in Ecdysozoa und Lophotrochozoa mit guten Daten zu belegen? Gehören die Pogonophora, Echiura, Sipuncula und Myzostomida zu den Annelida? Woher stammen die Myriapoda und Hexapoda? Fragen zur Methodik waren: Wie bewertet man Datenqualität in der molekularen Phylogenetik? Enstehen fehler nicht nur durch ungenügende Stichproben und unzureichende Modelle, sondern auch durch inherente systematische Fehler der verwendeten Algorithmen? Im Verlauf des Schwerpunktprogramms entstanden auch neue Sequenziertechnologien für Genomik, deren Potential erschlossen werden sollte. Ergebnisse: Die ursprüngliche Vorstellung, dass die Nutzung größerer Alinierungen das Signal-Rauschen-Verhältnis verbessert, hat sich nur teilweise bestätigt. Mit Simulationsstudien wurde entdeckt, dass es systematische Fehler gibt, die auch bei großen Datenmengen und verringertem Rauschen in den Daten Ergebnisse verfälschen. Ursachen sind die Heterogeneität von Astlängen und die Anhäufung von Plesiomorphien. Neue morphologische Entdeckungen nähren Zweifel an der molekular begründeten Dichotomie Ecdysozoa – Lophotrochozoa, mit konventionell analysierten molekularen Daten wird diese Gruppierung jedoch gestützt. Es konnten zahlreiche gut abgesicherte Ergebnisse erzielt werden. Beispiele: Die Zugehörigkeit „exotischer Würmer“ (Echiurida, Myzostomida u.a.) zu den Annelida, die Monophylie der Mandibulata, die Phylogenie innerhalb der Hexapoda. Die Ergebnisse des SPP „Deep Metazoan Phylogeny“ haben weltweit große Aufmerksamkeit erhalten, vor allem durch die hohe Qualität großer Datensätze und wegen neuartiger, komplexer Datenanalysen. Es ist eine neue Generation von sehr gut ausgebildeten Systematikern entstanden, von denen viele bereits Anschlussstellen gefunden haben. Die Integration morphologischer und molekularer Daten gelang nicht, da die morphologische Datenmatrix unvollständig blieb (zu wenig beteiligte Projekte), und das für die Integration in der 3. Förderphase vorgesehene Teilprojekt nicht bewilligt wurde.

Publications

  • A new look at the ventral nerve centre of Sagitta: implications for the phylogenetic position of Chaetognatha (arrow worms) and the evolution of the bilaterian nervous system. Frontiers in Zoology , Vol. 4.2007: 14.
    Harzsch S., Müller C.H.G.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1186/1742-9994-4-14)
  • Cnidarian milestones in metazoan evolution. Integrative and Comparative Biology, Vol. 47. 2007, Issue 5, pp. 693-700.
    Boero F., Schierwater B., Piraino S.
    (See online at https://doi.org/10.1093/icb/icm041)
  • Spiralian phylogenomics supports the resurrection of Bryozoa including Ectoprocta and Entoprocta. Molecular Biology and Evolution, Vol. 24.2007, Issue 12, pp. 2723-2729.
    Hausdorf, B., Helmkampf, M., Meyer, A., Witek, A., Herlyn, H., Bruchhaus, I., Hankeln, T., Struck, T. H., Lieb, B.
    (See online at https://doi.org/10.1093/molbev/msm214)
  • Lophotrochozoan relationships and parasites – a snap-shot. Parasite, Vol. 15. 2008, Number 3, pp. 329-332.
    Bleidorn, C.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1051/parasite/2008153329)
  • Multigene analysis of lophophorate and chaetognath phylogenetic relationships. Molecular Phylogenetics and Evolution, Vol. 46. 2008, Issue 1, pp. 206–214.
    Helmkampf M., Bruchhaus I., Hausdorf B.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2007.09.004)
  • A phylogenomic approach to resolve the basal pterygote divergence. Molecular Biology and Evolution, Vol. 26. 2009, Issue 12, pp. 2719-2730.
    Simon S., S. Strauss, A. von Haeseler, H. Hadrys
    (See online at https://doi.org/10.1093/molbev/msp191)
  • Hemocyanin suggests a close relationship of Remipedia and Hexapoda. Molecular Biology and Evolution, Vol. 26. 2009, Issue 12, pp. 2711-2718.
    Ertas B., von Reumont B.M., Wägele J.W., Misof B., Burmester T.
    (See online at https://doi.org/10.1093/molbev/msp186)
  • Morphological approaches to Deep Metazoan Phylogeny. Zoomorphology Volume 128. 2009, Issue 3 (Sonderheft), pp. 199-274.
    Andreas Schmidt-Rhaesa
  • Phylogeny and mitochondrial gene order variation in Lophotrochozoa in the light of new mitogenomic data from Nemertea. BMC Genomics, Vol. 10. 2009: 364.
    Podsiadlowski, L., Braband, A., Struck, T. H., v. Döhren, J., Bartolomaeus T..
    (See online at https://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-10-364)
  • Improved phylogenomic taxon sampling noticeably affects nonbilaterian relationships. Molecular Biology and Evolution, Vol. 27. 2010, Issue 9, pp. 1983-1987.
    Pick K.S., Philippe H., Schreiber F., Erpenbeck D., Jackson D.J., Wrede P., Wiens M., Alié A., Morgenstern B., Manuel M., Wörheide G.
    (See online at https://doi.org/10.1093/molbev/msq089)
  • Invertebrate neurophylogeny - suggested terms and definitions for a neuroanatomical glossary. Frontiers in Zoology Vol. 7. 2010: 29.
    Richter S., Loesel R., Purschke G., Schmidt-Rhaesa A., Scholtz G., Stach T., Vogt L., Wanninger A., Brenneis G., Döring C., Faller S., Fritsch M., Grobe P., Heuer C.M., Kaul S., Møller O.S., Müller C., Rieger V., Rothe B.H., Stegner M.E.J., Harzsch S.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1186/1742-9994-7-29)
  • Neurophylogeny – evolution of invertebrate nervous systems. Invertebrate Biology Vol. 129. 2010, No. 1: Neurophylogeny Theme Issue, pp. 1-104.
    S. Harzsch, R. Loesel, A. Wanninger
  • Phylogenomic analyses unravel annelid evolution. Nature, Vol. 471. 2011, Number 7336, pp. 95-98.
    Struck T, Paul C, Hill N, Hartmann S, Hösel C, Kube M, Lieb B, Meyer A, Tiedemann R, Purschke G, Bleidorn C.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1038/nature09864)
  • Top-Level Categories of Constitutively Organized Material Entities - Suggestions for a Formal Top-Level Ontology. PLoS One, Vol. 6.2011, Issue 4: e18794.
    Vogt L, Grobe P, Quast B, Bartolomaeus T.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0018794)
  • Isolation of hox cluster genes from insects reveals an accelerated sequence evolution rate. PLoS ONE, Vol. 7. 2012: e34682.
    Hadrys, H., S. Simon, B. Kaune, O. Schmitt, A. Schoner, W. Jakob, B. Schierwater
    (See online at https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0034682)
  • Long branch effects distort maximum likelihood phylogenies in simulations despite selection of the correct model. PLoS One, Vol. 7. 2012, Issue 5: e36593.
    Kück, P., Mayer, C., Wägele, J.W., Misof, B.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0036593)
  • A comprehensive analysis of bilaterian mitochondrial genomes and phylogeny. Molecular Phylogenetics and Evolution, Vol. 69. 2013, Issue 2, pp. 352–364.
    Bernt M., Bleidorn C., Braband A., Dambach J., Donath A., Fritzsche G., Hadrys H., Jühlinge F., Meusemann K., Middendorf M., Misof B., Perseke M., Podsiadlowski L., Von Reumont B., Schierwater B., Schlegel M., Schrödl M., Simon S., Stadler P.F., Stöger I., Struck T.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2013.05.002)
  • At the limits of a successful bauplan – 3D microanatomy and evolution of Helminthope (Mollusca: Heterobranchia), the most worm-like gastropod. Frontiers in Zoology, Vol. 10. 2013: 37.
    Brenzinger B., Haszprunar G., Schrödl M.
    (See online at https://dx.doi.org/10.1186/1742-9994-10-37)
  • Genetic aspects of mitochondrial genome evolution. Molecular Phylogenetics and Evolution, Vol. 69. 2013, Issue 2, pp. 328–338.
    Bernt, M., A. Braband, B. Schierwater, P. F. Stadler
    (See online at https://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2012.10.020)
  • Deep Metazoan Phylogeny: the backbone of the tree of life. 2014, xxv, 736 pages, ISBN 978-3-11-027752-4.
    Wägele, J.W:, Bartolomaeus, T.
    (See online at https://doi.org/10.1515/9783110277524)
 
 

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