Array-basierte SNP-Analyse bei der akuten myeloischen Leukämie des Erwachsenen mit normalem Karyotyp zur Identifizierung genomischer Imbalancen und uniparentaler Disomien
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Unsere umfassenden Untersuchungen bei der zytogenetisch normalen akuten myeloischen Leukämie (CN-AML) zeigen das Potenzial von hochauflösenden Single-Nukleotid-Polymorphismus (SNP)-Analysen zur Identifizierung genomischer Aberrationen, die auf potentiell pathogenetisch relevante Kandidatengene hinweisen, die von klinischer Relevanz sein könnten. Hier spielt vor allem die Identifizierung prognostisch relevanter uniparentaler Disomien (UPDs) sowie das Aufdecken kryptischer Translokationen eine Rolle; der prognostische Stellenwert dieser Veränderungen wird derzeit im Rahmen unabhängiger Studien umfassender evaluiert. Des Weiteren werden die aktuell laufenden weiterführenden Untersuchungen der funktionellen Relevanz der rekurrent betroffenen Gene (wie z.B. die von der 3p Deletion betroffenen Gene) zu einem besseren Verständnis der Leukämieentstehung beitragen und eventuell auch neue Ansatzpunkte für molekular zielgerichtete Therapieansätze liefern. Bei der Untersuchung der AML konnten wir zeigen, dass sich im Vergleich zur akuten lymphatischen Leukämie (ALL) nur relativ wenige genomische Veränderungen nachweisen ließen. Grund hierfür könnte sein, dass die Veränderungen bei der AML mit normalem Karyotyp entweder unterhalb der bereits sehr hohen Auflösung der SNP 6.0 Arrays liegen oder dass diese Veränderungen hauptsächlich als Punktmutationen oder nur wenige Basenpaare umfassende Insertionen/Deletionen vorkommen. Diesbezüglich werden neue Hochdurchsatz-Sequenzierverfahren (Next-Generation Sequencing, NGS) in Zukunft neue Erkenntnisse liefern. Für die Auswertung und Interpretation von NGS Daten ist eine gute molekulare Charakterisierung der untersuchten Proben von großem Vorteil, so dass die Ergebnisse unserer SNP-Analysen eine ideale Grundlage für weiterführende Untersuchungen bieten.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- Comment on 'Integrative genomic profiling of human prostate cancer'. Leukemia. 2010;24:1970-2
Bullinger L, Krönke J, Gaidzik V, Döhner H, Döhner K
- Identification of Acquired Copy Number Alterations and Uniparental Disomies in Cytogenetically Normal Acute Myeloid Leukemia Using High-Resolution Single Nucleotide Polymorphism Analysis. Leukemia. 2010;24:438-49
Bullinger L, Krönke J, Schön C, Radtke I, Urlbauer K, Botzenhardt U, Gaidzik V, Carió A, Senger C, Schlenk RF, Downing JR, Holzmann K, Döhner K, Döhner H
- Assessment of clonal evolution in 42 AML with NPM1 mutations by molecular characterization of paired diagnosis and relapse samples. Blood (ASH Annual Meeting Abstracts) 2011;118: Abstract 237
Krönke J, Bullinger L, Rücker FG, Gaidzik VI, Kühn MWM, Bezet K, Teleanu V, Paschka P, Späth D, Kindler T, Salih HR, Krauter J, Ganser A, Göhring G, Schlegelberger B, Schlenk RF, Döhner H, Döhner K
- Molecular Diagnostics in Hematologic Oncology. 2nd edition. Edited by S Stilgenbauer. UNI-MED, 2011
Bullinger L, Pollack JR, Döhner K
