Eine neue Resampling-Methode zur Untersuchung der Stabilität von Clustern bei der Genexpressionsanalyse

Zur Beurteilung der Stabilität von Clustern werden unter anderem Resampling-Verfahren eingesetzt. Die Anwendung von Gewichtungsmatrizen ist gegenüber dem herkömmlichen Bootstrap-Verfahren besonders bei kleinen Datensätzen vorteilhaft, da alle Beobachtungen aus dem ursprünglichen Datensatz berücksichtigt werden. Möglichst realistische Simulationen sollen klären, unter welchen Bedingungen die Verwendung von Gewichtungsmatrizen gegenüber dem Bootstrap-Verfahren Vorteile haben. Außerdem soll die Anwendung von Gewichtungsmatrizen für andere Anwendungsmöglichkeiten, bei denen bislang das Bootstrap-Verfahren eingesetzt wurde, untersucht werden. Bei der Identifizierung von differentiell exprimierten Genen sollen die Gewichtungsmatrizen mit einem modifizierten Bootstrap Test für kleine Fallzahlen verglichen werden.

DFG-Verfahren Sachbeihilfen