NMR Relaxation Dispersion Experiments for Structural Biology of Excited Protein States

• Applicant: Dr. Philipp Neudecker
• Subject Area: Structural Biology
• Term: from 2004 to 2007
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5443947

Wegen der Vielzahl der zugänglichen molekularen Parameter hat sich die NMR-Spektroskopie trotz der entsprechend großen spektralen Komplexität zur vielseitigsten Methode zur detaillierten Untersuchung der Struktur und Dynamik und damit der Funktionsweise von Proteinen entwickelt, seit die Entwicklung mehrdimensionaler Methoden die erforderliche Auflösung ermöglicht. Zur Reduktion der mit der Zahl der Dimensionen exponentiell zunehmenden Messzeit, die hohe Kosten verursacht und die praktische Durchführbarkeit vieler Projekte stark einschränkt, wurden in den letzten Jahren mehrere sogenannte Methoden reduzierter Dimensionalität vorgeschlagen. Im geplanten Forschungsvorhaben soll ein besonders einfaches und vielversprechendes dieser neuen Verfahren, die Rekonstruktion aus Projektionen niedrigerer Dimensionalität, an zwei besonders geeigneten medizinisch bedeutsamen Proteinen optimiert werden, und zwar sowohl in Hinblick auf methodische Aspekte wie Aufnahmeparameter und Rekonstruktionsalgorithmen als auch auf die zugänglichen Daten und deren biologische und medizinische Implikationen. Im einzelnen ist dies die weitgehend unstrukturierte regulatorische Domäne des Chloridionenkanals CFTR, dessen Defekt die häufigste Erbkrankheit Mukoviszidose verursacht, und das Acyl Carrier Protein des oft mehrfach antibiotikaresistenten Staphylococcus aureus, des Hauptverursachers von Krankenhausinfektionen.

• DFG Programme: Research Fellowships
• International Connection: Canada
• Host: Professor Lewis Kay, Ph.D.