Analysis of Verticillium longisporum-induced gene expression in Arabidopsis thaliana

• Applicant: Professorin Dr. Christiane Gatz
• Subject Area: Organismic Interactions, Chemical Ecology and Microbiomes of Plant Systems
• Term: from 2004 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5471048

Anliegen dieses Teilprojektes ist die Identifikation von Genen, die spezifisch durch den xylemlimitierten pathogenen Pilz Verticillium aktiviert werden. Um zunächst die Aktivierung bekannter pflanzlicher Signaltransduktionsnetzwerke durch Pilzinfektionen zu ermitteln, wird ein Makroarray mit 1200 Transkriptionsfaktoren verwendet, da hier Gene repräsentiert sind, die durch die verschiedensten Signale aktiviert werden. Durch die Verwendung von Arabidopsis-Mutanten mit Defekten in Biosynthesewegen und Signaltransduktionsnetzwerken pflanzeneigener Signalmoleküle können diejenigen Genen identifiziert werden, die erst sekundär durch die Veränderung des Hormonstatus der Pflanze induziert werden. Promotoren, die primär durch pilzliche Signale induziert werden, sollen in ihrem zeitlichen und räumlichen Expressionsmuster nach Infektion durch Reportergenfusionen näher charakterisiert werden. Weiterhin sollen sie zur Überprüfung der biologischen Aktivität angereicherter neuer Signalmoleküle dienen.

• DFG Programme: Research Units
• Subproject of: FOR 546: Analysis of Systemic Effects of Infections of Selected Brassicaceae by Soil-borne Microorganisms Considering Especially Multitrophic Interactions with Insects and Microbial Pathogens