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Rasterkraftmikroskopische Charakterisierung von Proteinkomplexen der DNA-Reparatur

Subject Area Biophysics
Term from 2004 to 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5423352
 
Final Report Year 2008

Final Report Abstract

Unsere Forschungsarbeiten konzentrierten sich vor allem auf die Wechselwirkung des humanen Einzelstrang-DNA-Bindungsproteins RPA mit geschädigter DNA. Wir konnten spezifische Komplexe von hRPA mit UV-geschädigter und Cisplatin-modifizierter DNA im AFM abbilden und Aussagen über die Topologie der DNA im Komplex erhalten. Die Daten zeigen, dass hRPA sich um geschädigte DNA herum windet. Für das archaeale Einzelstrang-DNA-Bindungsprotein SsoSSB konnte eine spezifische Bindung an ssDNA sichtbar gemacht werden, eine Bindung an geschädigte DNA war aber im AFM nicht feststellbar. Für das sequenzspezifische archaeale dsDNA-Bindungsprotein ORF80 ist es uns gelungen, die Bindung an zwei spezifische Bindungsstellen auf einem langen DNA-Fragment in hoher Auflösung abzubilden. Eine Längenverkürzung der gebundenen DNA war hier nicht feststellbar, so dass man von einer Bindung von ORF80 an linear ausgestreckte DNA ausgehen muss.

Publications

  • Site-specific binding of the 9.5 Kilodalton DNA-Binding protein ORF80 visualized by Atomic Force Microscopy'; (2005) Biomacromolecules 6, 1252-1257
    Lysetzka, M., Zettl, H., Oka, G., Lipps, G., Krauss, G. and Krausch, G.
  • 'Characterization of SsoSSB, Sso1450, Sso2001 proteins and Analysis of CRISPR and cas Genes from Sulfolobus solfataricus P2'. Universitat Bayreuth, 2008
    Han Dong
 
 

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