Genome evolution within the Viridiplantae EST-analysis of a green flagellate (Mesostigma viride, Streptophyta)

• Applicant: Professor Dr. Burkhard Becker
• Subject Area: Evolution and Systematics of Plants and Fungi
• Term: from 2002 to 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5385756

Mesostigma viride wird als der einfachste Vertreter der streptophytischen Algen angesehen. Ob M. viride an der Basis aller Grünalgen steht oder zu den streptophytischen Algen gehört, ist noch nicht endgültig geklärt, aber die Untersuchungen haben gezeigt, dass M. viride von besonderer Bedeutung für das Verständnis der Evolution der Streptophyta {Embryophyten + streptophytische Algen (Charophyceae sensu Mattox & Stewart)} ist. Im vorgeschlagenen Projekt sollen 10.000 ESTs (Expressed Sequence Tags) von Mesostigma viride sequenziert und analysiert werden. Durch Vergleich der erhaltenen ESTs mit dem Arabidopsis-Genom und den EST-Datenbanken weitere Embryophyten als auch der EST-Datenbank bzw. dem Genom von Chlamydomonas reinhardtii (Chlorophyta) sollen Rückschlüsse auf die Gen- und Genomevolution (Entstehung und Evolution von Genen und Genfamilien, Verlust von Genen und Genfamilien) in den Viridiplantae gezogen werden. Insbesondere hoffen wir ursprüngliche Merkmale der Viridiplantae (Vergleich Mesostigma(Streptophyta)/Chlamydomonas (Chlorophyta) und Embryophyten (Vergleich Mesostigma/Embryophyten) identifizieren zu können.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Professor Dr. Michael Melkonian