The distribution and organisation of repetitive DNA elements in Brassica genomes

• Applicant: Professor Dr. Wolfgang Köhler (†)
• Subject Area: Plant Breeding and Plant Pathology
• Term: from 2000 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5233816

Pflanzengenome bestehen zum großen Teil aus unterschiedlichen repetitiven DNA-Elementen. Dazu gehören einerseits die sogenannten "tandem repeat"-Sequenzen (z.B. Satelliten-DNA, Telomer-Sequenzen und rDNA-Gene) und andererseits die "dispersed repeat"-Sequenzen (z.-B. Transposons und Retroelemente). Die Analyse der genomischen Verteilung und Organisation dieser repetitiven DNA-Sequenzen kann zur Aufklärung der Genomstrukltur und -evolution zwischen verwandten Arten beitragen. Auf diesem Gebiet wurden in den letzten Jahren mit Hilfe der Fluoreszenz-in situ-Hybridisierung (FISH) große Fortschritte erzielt. Für die Gattung Brassica, zu der zahlreiche agronomisch wichtige Gemüse- und Ölpflanzen gehören, gibt es bislang erst wenig Kenntnis über die physische Organisation repetitiver DNA. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist es, verschiedene Klassen repetitiver DNA-Elemente bei Brassica-Arten mittels FISH auf chromosomaler Ebene zu identifizieren, die genomische Organisation wesentlicher, repetitiver Motive innerhalb der einzelnen Brassica-Genome aufzuklären und vergleichende Analysen der verschiedenen Genome durchzuführen.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Professor Dr. Wolfgang Friedt