Funktionelle Charakterisierung von Arabidopsis-Linien mit Hilfe der Proteomanalytik

• Applicant: Privatdozent Dr. Hans-Peter Mock
• Subject Area: Plant Sciences
• Term: from 1999 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5227890

Der eingereichte Antrag setzt sich die Etablierung und Nutzung der Proteomanalytik bei pflanzlichen Objekten zum Ziel. Aufgrund der sich abzeichnenden kompletten Sequenzierung des Genoms soll mit der Modellpflanze Arabidopsis thaliana gearbeitet werden. Das erste Projekt umfaßt die Charakterisierung von transgenen Linien und von Mutanten des Sekundärstoffwechsels, um regulatorische Netzwerke aufzuklären. Mit Hilfe der 2D-Gelelektrophorese sollen Proteinmuster von transgenen Linien bzw. Mutanten erstellt und mit Wildtyp-Mustern verglichen werden. Proteine, die neu oder unterschiedlich exprimiert werden, sollen isoliert und mit Hilfe der Massenpektrometrie identifiziert werden. Ein weiteres Projekt setzt sich die Analyse von Trichomen zum Ziel, um mit der Kenntnis möglichst vieler identifizierter Proteine funktionelle Bezüge eines spezifisch differenzierten Zelltypus aufzudecken. Die proteinchemischen Arbeiten sollen von Genom- und Metabolitanalysen begleitet werden, um eine umfassende funktionelle Charakterisierung zu gewährleisten. Die Etablierung der Techniken zur Proteomanalytik soll über die vorgeschlagenen Arbeiten hinaus wegbereitend für zukünftige Projekte mit Gerste im Rahmen von Aktivitäten des Pflanzengenom-Ressorcen-Centers des Institutes sein.

• DFG Programme: Research Grants
• Major Instrumentation: MALDI-TOF-Massenspektrometer mit Pipettierroboter
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer