Strukturelle Grundlagen der Protonendynamik in Viroporinen durch Multiskalenmodellierung und -simulation (C07*)

Fachliche Zuordnung Biophysik
Förderung Förderung von 2021 bis 2024
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 221545957
 

Projektbeschreibung

In diesem Projekt werden rechnergestützte Methoden entwickelt und angewendet, mit denen die Kopplung zwischen langsamen Konformationsänderungen und Protonierungsdynamik in Proteinen untersucht werden können. Durch die Kombination von statistischer Mechanik, maschinellem Lernen und Moleküldynamik-Simulationen werden wir grobkörnige und multiskalige Modelle der globalen Strukturänderungen und deren Kopplung mit (De-)Protonierungsereignissen in Phytochromen untersuchen. Außerdem werden wir die strukturelle Basis der Protonenleitung in den neuen viralen Protonenkanälen (Viroporine) erforschen.
DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche
Teilprojekt zu SFB 1078:  Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik
Antragstellende Institution Freie Universität Berlin
Teilprojektleiterin Professorin Cecilia Clementi, Ph.D.