Strukturelle Grundlagen der Protonendynamik in Viroporinen durch Multiskalenmodellierung und -simulation (C07*)

In diesem Projekt werden rechnergestützte Methoden entwickelt und angewendet, mit denen die Kopplung zwischen langsamen Konformationsänderungen und Protonierungsdynamik in Proteinen untersucht werden können. Durch die Kombination von statistischer Mechanik, maschinellem Lernen und Moleküldynamik-Simulationen werden wir grobkörnige und multiskalige Modelle der globalen Strukturänderungen und deren Kopplung mit (De-)Protonierungsereignissen in Phytochromen untersuchen. Außerdem werden wir die strukturelle Basis der Protonenleitung in den neuen viralen Protonenkanälen (Viroporine) erforschen.

DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche

Teilprojekt zu SFB 1078:  Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik

Antragstellende Institution Freie Universität Berlin

Teilprojektleiterin Professorin Cecilia Clementi, Ph.D.