Genomweite Identifizierung der Virulenzfaktoren eines Gallen-induzierenden Pilzes

• Antragsteller: Professor Dr. Armin Djamei
• Fachliche Zuordnung: Organismische Interaktionen, chemische Ökologie und Mikrobiome pflanzlicher Systeme ; Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 435107456

Im Laufe der letzten Jahrzehnte entwickelte sich der Mais-infizierende Pathogen Ustilago maydis zu einem Modell für biotrophe Pflanze-Pilz Interaktionen. Obwohl es sich um einen sehr gut studierten Pilzpathogen handelt, sind bis heute 40% seiner Gene ohne bekannte Funktion und wir sind weit davon entfernt zu verstehen, wie sich dieser Parasit in der Wirtspflanze etabliert. Wir haben innovative Methoden entwickelt um Transposon Mutanten Bibliotheken zu generieren und in negativen Selektionsscreens tausende von Mutanten auf ihre Fitness während der biotrophen Phase zu testen. Transgene, haploide Stämme welche verschiedene Stadien der pathogenen Entwicklung in axenischer Kultur durchlaufen können werden Verwendung finden um Transposon Mutanten Bibliotheken zu generieren um diese in negativen Selektionsscreens gefolgt von iPool-Seq zu analysieren. Das Hauptziel des Projekts ist die Generierung einer genomweiten Virulenzfaktor Karte um unser Verständnis bezüglich der Etablierung der Biotrophie zu vertiefen. Auf unserem Weg zu diesem Ziel werden neue Ressourcen und Wissen generiert, wie die genomweiten Mutanten Bibliotheken welche auf andere interessante Aspekte des Lebenszyklus von U. maydis untersucht werde können. An neu generiertem Wissen wird zusätzlich eine Liste aller essentiellen Gene dieses wichtigen Basidiomyceten und die Identifizierung von Genen die in der b-abhängigen Filamentbildung involviert sind zu erwarten sein.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen