Reconstruction of the phylogeny of anaerobic chytridiomycetes (Neocallimasticales, Fungi) based on multigene-genealogie
Final Report Abstract
Ziel des abgeschlossenen Projekts war die Aufklärung der stammesgeschichtlichen Beziehungen zwischen aeroben und anaeroben Chytridiomyceten, um unser Wissen über die wenig erforschte Evolutionsgeschichte der anaeroben Pilze im großen Maßstab unter Verwendung von Neu-Isolaten und Beschreibung neuer Arten zu vergrößern. Darüber hinaus zielte das Projekt auf die phylogenetische Rekonstruktion der Wurzel des Reichs der Pilze ab, wobei ein methodischen Ansatz basierend auf Sequenzanalyse von einer Vielzahl von Proteinkodierenden Genen verwendet wurde. Vor Beginn des vorliegenden Projekts wurden aeroben und anaeroben Chytridiomyceten noch nie phylogenetisch mit Hilfe von Protein-kodierenden Genen untersucht. Die Idee einer Phylogenie der synoptischen Analyse von aeroben und anaeroben Chytridiomyceten mit Hilfe von Multigen-Genealogien war neu und vielversprechend. Im Rahmen des Projekts wurden über 200 Nukleotidsequenzen erzeugt und eine Sequenzdatenbank von ca. 280.000 Sequenzen angelegt, die als Referenzdatenbank für populationsökologische Untersuchungen dienen soll. Multigen-Analysen bestätigen die Polyphylie mono- und polyzentrischer Gattungen. Die Gattungs- wie die Familienstruktur der Neocallimastigales ist revisionsbedürftig. Phylogenomische Analysen bestätigen hingegen die Monophylie der flagellaten Pilze, wobei die Blastocladiomycota basal zu den beiden Schwesterngruppen der Chytridio- und Neocallimastigomycota gruppieren. Die Fähigkeit mit dem für die Pilzgruppe toxischen Luftsauerstoff umzugehen, haben die Neocallimastigomycota demnach sekundär während der Evolution und Anpassung an die hoch spezialisierte Nische Wiederkäuermagen verloren.
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