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Integrating phylogenomics, natural history collection holdings, innovative morphology and paleontological data - The phylogeny and evolution of adephagan beetles as a case study

Subject Area Systematics and Morphology (Zoology)
Term from 2017 to 2021
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 367847602
 
Final Report Year 2022

Final Report Abstract

In diesem Projekt wurden Käfer der Unterordnung Adephaga phylogenetisch untersucht. Diese Gruppe ist morphologisch sehr vielfältig, und umfasst sowohl terrestrisch lebende Linien, wie z. B. die Laufkäfer und Sandlaufkäfer, als auch aquatisch lebende Linien mit ganz unterschiedlichen Lebensweisen auf Familienniveau (z. B. Taumel- und Schwimmkäfer). Mit etwa 45.000 beschriebenen Arten machen die Adephaga ca. 10% der gesamten Käfervielfalt aus. Unser Ansatz bestand darin, neue phylogenomische, paläontologische und morphologische Datensätze zusammenzustellen und diese zu kombinieren, um eine umfassende evolutionäre Rekonstruktion dieser Käfer herleiten zu können. Diese soll vor allem als Fundament für alle zukünftigen phylogenetischen, paläontologischen, evolutionsbiologischen, biogeographischen und taxonomischen Untersuchungen an Adephaga dienen. Damit könnten auf spezifische Linien fokussierte Studien, zum Beispiel auf Familien-, Gattungs- oder Artengruppenniveau, in ein globales Rahmenwerk eingebunden werden. Wir haben eine umfassende Revision jener morphologischen Merkmale durchgeführt, die für phylogenetische Rekonstruktionen der Adephaga relevant erscheinen. Diese Merkmale spiegeln die morphologische Evolution der Adephaga wider und damit die Anpassung an verschiedenste Lebensräume und Lebensweisen. Beispiele sind die geteilten Augen und extrem modifizierten Beine der adulten Taumelkäfer als Anpassung an ein Leben im Oberflächenfilm von Gewässern. Zudem haben wir basierend auf existierenden sowie de novo sequenzierten Transkriptomen ein Proben-Set von 651 Markern erzeugt, um fokussiert bestimmte Bereiche des Genoms amplifizieren und sequenzieren zu können. Dies diente vor allem dem Erschließen von älteren Museumsproben, die mit herkömmlichen Methoden kaum für phylogenomische Projekte verwendet werden können. Dieser Ansatz war erfolgreich und so konnten neben rezent gesammelten Exemplaren auch bis zu über 100 Jahre alte Proben eingebunden werden. Wir konnten erstmals Daten des seltenen Schwimmkäfer Regimbartina pruinosaaus dem tropischen Afrika von einem >100 Jahre alten Museumsexemplar gewinnen. Diese Daten wurden erfolgreich analysiert und publiziert. Eine detaillierte Analyse der Phylogenie der Schwimmkäfer wird in absehbarer Zeit abgeschlossen. Diese Arbeit mit mehr als 150 terminalen Taxa stellt aktuell die umfassendste derartige Studie dar und wird in nächster Zukunft die Basis für eine Reihe von neuen Schwimmkäferprojekten werden. Dabei geht es vor allem um eine verbesserte Datierung der wichtigsten Ereignisse während der Evolution der Dytiscidae in einem robusten phylogenomischem Rahmenwerk. Das von uns ursprünglich geplante paläontologische Arbeitspaket konnte zwar aufgrund der Pandemie nicht durchgeführt werden. Dennoch haben wir und andere Arbeitsgruppen neue Daten zu fossilen Belegen der Adephaga und insbesondere der Dytiscidae gesammelt. Mit umfangsreichen Neuentdeckungen vor allem aus Sibirien, China sowie dem burmesischen Bernstein darf gerechnet werden. Alle diese Belege können anhand unserer phylogenetischen Rekonstruktionen zu verbesserten zeitlichen Hypothesen zur Evolution der Adephaga herangezogen werden und zum Beispiel neue Modelle zur biogeographischen Geschichte dieser Käfer liefern.

Publications

  • (2019) Electruphilus wendeli gen. n., sp. n.-the first diving beetle recorded from Saxonian (Bitterfeld) Amber (Coleoptera: Dytiscidae: Laccophilinae). Russian Entomological Journal 28: 350–357
    Balke M, Toledo M, Gröhn C, Rappsilber I, Hendrich L
    (See online at https://doi.org/10.15298/rusentj.28.4.02)
  • (2019): Phylogenomics of the superfamily Dytiscoidea (Coleoptera: Adephaga) with an evaluation of phylogenetic conflict and systematic error. Molecular Phylogenetics and Evolution 135: 270–285
    Vasilikopoulos A, Balke M, Beutel RG, Donath A, Podsiadlowski L, Pflug JM, Waterhouse RM, Meusemann K, Peters RS, Escalona HE, Mayer C, Liu S, Hendrich L, Alarie Y, Bilton DT, Jia F, Zhou X, Maddison DR, Niehuis O, Misof B
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.ympev.2019.02.022)
  • (2020) The morphological evolution of the Adephaga (Coleoptera). Systematic Entomology 45: 378–395
    Beutel RG, Ribera I, Fikáček M, Vasilikopoulos A, Misof B, Balke M
    (See online at https://doi.org/10.1111/syen.12403)
  • 2020. Burmapseudomorphus planus gen. et sp. nov. – a Late Cretaceous stem group member of the specialized Pseudomorphini (Carabidae, Coleoptera) from northern Myanmar. Cretaceous Research 107: 104274
    Beutel, R.G., Liu, Z., Fikáček, M., Ren, D., Pang, H., Ślipiński, A.
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.cretres.2019.104274)
  • (2021) Resolving the phylogenetic position of Hygrobiidae (Coleoptera: Adephaga) requires objective statistical tests and exhaustive phylogenetic methodology: a response to Cai et al. (2020). Molecular Phylogenetics and Evolution 162: 106923
    Vasilikopoulos A, Gustafson GT, Balke M, Niehuis O, Beutel RG, Misof B
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.ympev.2020.106923)
  • (2021) The enduring value of reciprocal illumination in the era of insect phylogenomics: a response to Cai et al. (2020). Systematic Entomology 46: 473–486
    Gustafson GT, Miller KB, Michat MC, Alarie Y, Baca SM, Balke M, Short AE
    (See online at https://doi.org/10.1111/syen.12471)
  • (2021): Phylogenomic analyses of taxon-rich datasets consolidate the evolution of Adephaga (Coleoptera) and highlight biases due to model misspecification and excessive data trimming. Systematic Entomology 46: 991–1018
    Vasilikopoulos A, Balke M, Kukowka S, Pflug JM, Martin S, Meusemann K, Hendrich L, Mayer C, Maddison DR, Niehuis O, Beutel RG, Misof B
    (See online at https://doi.org/10.1111/syen.12508)
 
 

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