A role for the histone deacetylase Rpd3 in the establishment of histone acetylation patterns at telomeres in Saccharomyces cerevisiae
Final Report Abstract
Chromatin-Domänen im eukaryoten Zellkern teilen das Genom in exprimierte und reprimierte Bereiche auf. Damit die Domänen ihre epigenetische Identität bewahren, gibt es Chromatinbarrieren im Grenzbereich, die das Übergreifen der einen Domäne in die andere verhindern. In diesem Projekt haben wir eine unerwartete Barriere-Funktion für die Histon-Deacetylase Rpd3 gefunden und charakterisiert. Die Abwesenheit von Rpd3 führte zu einer Ausbreitung des telomerischen Heterochromatins und damit einhergehender Genrepression und zu Änderungen der Histon-Acetylierung in subtelomerischen Bereichen. Bei direkter Rekrutierung an heterochromatische Bereiche war Rpd3 in der Lage, deren Ausbreitung zu verhindern. Dies war erstaunlich, weil üblicherweise Histon-Deacetylierung mit dem gegenteiligen Effekt, einer verbesserten Repression in Zusammenhang gebracht wird. Mechanistisch scheint Rpd3 zu agieren, indem es einem konkurrierenden Enzym, der Deacetylase Sir2, das Substrat entzieht, wodurch die Propagierung des heterochromatischen Sir2/ Sir3/ Sir4-Komplexes entlang des Chromatins verhindert wird.
Publications
- (2010). Rpd3-dependent boundary formation at telomeres by removal of Sir2 substrate. Proc Natl Acad Sci U S A 107 (12): 5522-5527
Ehrentraut S, Weber JM, Dybowski JN, Hoffmann D, Ehrenhofer-Murray AE
- (2011). Structural basis for the role of the Sir3 AAA+ domain in silencing: Interaction with Sir4 and unmethylated histone H3K79. Genes Dev Sep 1, 2011; 25 (17), 1835 - 46
Ehrentraut, S., Hassler, M., Oppikofer, M., Kueng, S., Weber, J. M., Mueller, J. W., Gasser, S. M., Ladurner, A. G. and A. E. Ehrenhofer-Murray
