Rekonstruktion der klonalen Krebsevolution mittels Änderungen im Transkriptom und somatischer Mutationen (A15)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Humangenetik
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 278529602

Wir werden bioinformatische Methoden entwickeln, um die klonale Struktur in AML-Patientenproben zu bestimmen und diese klonale Struktur mit Genexpressionsprofilen von Einzelzellen zu verbinden. Ferner werden wir Methoden entwickeln, um die Expressionsvarianz quantitativ zwischen verschiedenen Klonen und Zelltypen zu vergleichen. Mit diesen Methoden können wir dann testen, ob Mutationen in den epigenetischen Modifikatoren DNMT3A und TET2 einen epigenetischen Mutatorphänotyp induzieren. Dazu planen wir die Änderungen in der Expressionsvarianz, die durch diese Mutationen verursacht werden, in einer Zelllinie und in Patientenproben zu analysieren.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1243: Genetische und epigenetische Evolution von hämatopoetischen Neoplasien
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiterin: Privatdozentin Dr. Ines Hellmann