Polymer dynamic theories, Markov state models and protein folding free energy landscapes (B02)

• Subject Area: Statistical Physics, Nonlinear Dynamics, Complex Systems, Soft and Fluid Matter, Biological Physics
• Term: from 2014 to 2018
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 235221301

Für vereinfachte Polymermodelle wird die Beziehung zwischen Markovmodellen und den klassischen Rouse und Zimm Theorien für Polymerdynamik untersucht. Die Änderung des Markov-Eigenwertspektrums für komplexere Polymermodelle die Polymerkollaps, Proteinfaltung und die korrekte Rückgratstruktur beschreiben wird betrachtet. Hier werden vergröberte und atomistische Simulationen von Polymeren und Peptiden benutzt. Die Beziehung zwischen Markovmodellen und der Beschreibung der Proteinfaltung als Diffusion in einer niedrig-dimensionalen Energielandschaft wird geklärt.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 1114: Scaling Cascades in Complex Systems
• Applicant Institution: Freie Universität Berlin
• Project Heads: Professor Dr. Roland Netz; Professor Dr. Frank Noé