Kommunikation und Protonierungsdynamik in Cytochrom-c-Oxidase in Abhängigkeit vom Redox-Zustand (C05)

Der Protonentransfer in Cytochrom-c-Oxidase entlang der sogenannten D- und K-Kanäle wird mit einer Kombination aus klassischen Molekulardynamiksimulationen und quantenchemischen Berechnungen erforscht. Diskrete Protonierungs- und Konformationszustände werden zu einem Übergangsnetzwerk verknüpft, und damit der wahrscheinlichste Protonentransferpfad bestimmt. Wir werden außerdem die Kommunikation innerhalb des Proteins, z.B. zwischen den beiden Kanälen, untersuchen. Des Weiteren soll der Einfluss des Redoxzustands auf diese Kommunikations- und auf die Protonentransferpfade erforscht werden um so ein umfassendes Bild der Kopplung von Redox-Reaktion und Protonierungsdynamik zu erhalten.

DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche

Teilprojekt zu SFB 1078:  Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik

Antragstellende Institution Freie Universität Berlin

Teilprojektleiterin Professorin Dr. Petra Imhof, bis 3/2019