Predictive modelling of host pathogen interactions by reconstruction of gene regulatory networks (B03)

• Subject Area: Bioinformatics and Theoretical Biology
• Term: from 2013 to 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 210879364

Netzwerke der Genregulation werden rekonstruiert mit einem top down-Ansatz basierend auf der Analyse von Hochdurchsatzdaten, insbesondere Transkriptomdaten von Wirt und Pathogen, wobei Vorwissen z.B. über Informationen über Promotor-Sequenzen, integriert wird. Die so gewonnenen Netzwerk-Modelle sind Grundlage für eine verbesserte Diagnose und Therapie von Pilzinfektionen. Weiterhin wird der Einfluss von nicht-kodierenden RNAs auf die Wirt-Pathogen-Wechselwirkung untersucht.

• DFG Programme: CRC/Transregios
• Subproject of: TRR 124: Pathogenic Fungi and their Human Host: Networks of Interaction - FungiNet
• Applicant Institution: Friedrich-Schiller-Universität Jena
• Co-Applicant Institution: Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e. V.; Hans-Knöll-Institut (HKI)
• Project Heads: Professor Dr. Reinhard Guthke; Professorin Dr. Manja Marz; Dr. Ekaterina Shelest