Analysis on the origin, function and regulation of B-chromosome located gene fragments

• Applicant: Privatdozent Dr. Andreas Houben
• Subject Area: Plant Genetics and Genomics
• Term: from 2012 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 221477818

Bislang wurden B-Chromosomen (Bs) als „nicht-funktional“ und ohne kodierende Funktion beschrieben. Die Identifizierung von B-lokalisierten Gensequenzen mit Ähnlichkeit zu Kopien auf den Standard-Chromosomen (As) des Roggens war daher unerwartet. Ziel ist es, den Ursprung, Funktion and Regulation von B-lokalisierten Gen(fragment)en zu erkunden. Dazu soll die Sequenzabdeckung des B Chromosoms erhöht werden, um Aussagen zur Intaktheit und dem Ursprung von B-lokalisierten Genen treffen zu können. Der Transkriptionszustand, die Regulierung und das Zusammenspiel von A- und B-lokaliserten Genen soll mit Hilfe von „RNAseq“, RT-PCR und Methylierungsanalyse geprüft werden. Es werden Neuerkenntnisse zur Ausprägung von Phänotypen, die von Genkopiezahlen-abhängig sind, analog zu Aneuploidie, erwartet.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Dr. Ali M. Banaei-Moghaddam