The role of UPF1 phosphorylation during nonsense-mediated mRNA decay (B06)

• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2011 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5485912

Der Nonsens-vermittelte mRNA Abbau (NMD) ist ein Mechanismus der Genexpressionskontrolle,der fehlerhafte mRNAs abbaut und dadurch die Zelle vor den möglicherweiseschädlichen Folgen der Produkte von mutierten Genen schützt. Das zentrale NMD-ProteinUPF1 spielt eine wichtige Rolle während der Erkennungs- und Abbauphasen des NMD.UPF1 benötigt einen Phosphorylierungs- (durch die Kinase SMG1) und Dephosphorylierungszyklus(durch PP2A) für seine normale Funktion. Die Proteine SMG5/6/7interagieren spezifisch mit phosphoryliertem UPF1 und stimulieren dessen Dephosphorylierung.Wir werden mittels Massenspektrometrie und dem Screening einer Peptidbibliothekdie Motive von UPF1 identifizieren, die von SMG5/6/7 erkannt werden. DieBedeutung der Komplexbildung zwischen UPF1 und SMG5/6/7 wird anschließend mitfunktionellen NMD-Assays untersucht werden.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 635: Posttranslational Control of Protein Function
• Applicant Institution: Universität zu Köln
• Project Head: Professor Dr. Niels H. Gehring